Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB7P26010 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB7P26010 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB7P26010 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB7P26010 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB7P26010 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms