Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-11■■■■■ 50.3
RPS3P23396 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-11■■■■■ 50.3
RPS3P23396 SDHC-207ENST00000504963 571 ntTSL 46.62□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 50.3
RPS3P23396 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 50.3
RPS3P23396 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.612e-11■■■■■ 50.3
RPS3P23396 NDUFB5-211ENST00000488002 842 ntTSL 210.69□□□□□ -0.78e-9■■■■■ 50.3
RPS3P23396 UQCRC1-206ENST00000467690 931 ntTSL 219.15■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 50.2
RPS3P23396 UQCRC1-205ENST00000463708 739 ntTSL 312.81□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 50.2
RPS3P23396 PSMB3-209ENST00000614132 426 ntTSL 23.92□□□□□ -1.781e-10■■■■■ 49.9
RPS3P23396 HP-210ENST00000565807 935 ntTSL 25.37□□□□□ -1.559e-14■■■■■ 49.8
RPS3P23396 SDHC-209ENST00000515731 651 ntTSL 315.32■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 49.7
RPS3P23396 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 49.6
RPS3P23396 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 49.3
RPS3P23396 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 49.3
RPS3P23396 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 49.3
RPS3P23396 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 49.3
RPS3P23396 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 49.3
RPS3P23396 A1BG-204ENST00000598345 475 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.826e-16■■■■■ 49.3
RPS3P23396 A1BG-203ENST00000596924 2134 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.496e-16■■■■■ 49.3
RPS3P23396 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 49.3
RPS3P23396 PRDX3-202ENST00000463322 450 ntTSL 23.04□□□□□ -1.921e-12■■■■■ 49.2
RPS3P23396 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-323■■■■■ 49.2
RPS3P23396 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-10■■■■■ 49
RPS3P23396 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 49
RPS3P23396 TBL3-201ENST00000332704 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.48e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 TBL3-206ENST00000569628 2594 ntTSL 215.66■□□□□ 0.18e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.284e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 NOB1-203ENST00000562416 556 ntTSL 218.19■□□□□ 0.54e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 PPP2R1A-202ENST00000391791 979 ntTSL 217.49■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 ELF1-202ENST00000405737 903 ntTSL 216.99■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 GMPPA-208ENST00000455657 907 ntTSL 516.8■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 NOB1-206ENST00000569871 845 ntTSL 516.11■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 NOB1-205ENST00000564620 812 ntTSL 215.46■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 GMPPA-210ENST00000480506 835 ntTSL 512.1□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 GMPPA-206ENST00000435316 786 ntTSL 511.3□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 VDAC2-207ENST00000460044 770 ntTSL 210.69□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 GMPPA-214ENST00000635609 569 ntTSL 510.56□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 HPX-206ENST00000529037 672 ntTSL 28.83□□□□□ -14e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 ANXA6-214ENST00000523164 923 ntTSL 58.75□□□□□ -1.014e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.354e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 49
RPS3P23396 VDAC2-201ENST00000298468 931 ntTSL 55.72□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 49
RPS3P23396 HIST1H2BB-201ENST00000615966 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-14■■■■■ 48.9
RPS3P23396 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 48.8
RPS3P23396 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 48.8
RPS3P23396 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 48.8
RPS3P23396 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 48.6
RPS3P23396 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 48.6
RPS3P23396 CLIC2-201ENST00000321926 629 ntTSL 33.46□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 48.5
RPS3P23396 KDELR1-205ENST00000600980 815 ntTSL 38.89□□□□□ -0.992e-11■■■■■ 48.3
RPS3P23396 KDELR1-204ENST00000599084 582 ntTSL 28.25□□□□□ -1.095e-16■■■■■ 48.3
RPS3P23396 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.623e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-214ENST00000592849 846 ntTSL 218.16■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 TMEM41A-202ENST00000382227 541 ntTSL 417.94■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 FAM96B-206ENST00000569299 708 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 TMEM41A-205ENST00000467520 563 ntTSL 417.31■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 TMEM41A-204ENST00000467061 4921 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 NUP188-207ENST00000487952 568 ntTSL 213.86□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 TMEM41A-206ENST00000475480 1035 ntTSL 312.32□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 NUP188-205ENST00000477069 2941 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-213ENST00000591571 585 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-206ENST00000588563 581 ntTSL 27.57□□□□□ -1.23e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 48.2
RPS3P23396 LGALS1-207ENST00000489315 516 ntTSL 317.58■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 48.2
RPS3P23396 LGALS1-205ENST00000472321 546 ntTSL 217.58■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 48.2
RPS3P23396 LGALS1-202ENST00000425542 637 ntTSL 317.58■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 48.2
RPS3P23396 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 48.2
RPS3P23396 LGALS1-203ENST00000454173 331 ntTSL 513.31□□□□□ -0.282e-16■■■■■ 48.2
RPS3P23396 MRPL2-205ENST00000480286 661 ntTSL 213.46□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 48.2
RPS3P23396 GCN1-207ENST00000550471 918 ntTSL 319.29■□□□□ 0.682e-13■■■■■ 48.1
RPS3P23396 GCN1-203ENST00000547369 595 ntTSL 317.85■□□□□ 0.452e-13■■■■■ 48.1
RPS3P23396 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 48.1
RPS3P23396 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 48.1
RPS3P23396 RAB11B-204ENST00000600719 532 ntTSL 414.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 48.1
RPS3P23396 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 48.1
RPS3P23396 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 48.1
RPS3P23396 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 48.1
RPS3P23396 SLC35A4-204ENST00000623481 683 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 48.1
RPS3P23396 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 48.1
RPS3P23396 COPG1-209ENST00000514478 734 ntTSL 38.81□□□□□ -12e-6■■■■■ 48.1
RPS3P23396 HSPD1-203ENST00000418022 533 ntTSL 417.66■□□□□ 0.424e-61■■■■■ 48.1
RPS3P23396 NUP160-207ENST00000528501 1961 ntTSL 216.47■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 48
RPS3P23396 PSMB7-204ENST00000474081 546 ntTSL 56.39□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 48
RPS3P23396 PSMB7-205ENST00000478817 388 ntTSL 53.78□□□□□ -1.81e-8■■■■■ 48
RPS3P23396 MRPL2-209ENST00000491898 1020 ntTSL 213.9□□□□□ -0.187e-8■■■■■ 48
RPS3P23396 MRPL2-204ENST00000470667 765 ntTSL 510.51□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 48
RPS3P23396 UCP2-207ENST00000543714 567 ntTSL 213.75□□□□□ -0.218e-12■■■■■ 47.8
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