Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6AP20340 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6AP20340 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB6AP20340 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms