Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM225BP0DP42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM225BP0DP42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM225BP0DP42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms