Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 RPR1RPR1 369 nt12.51□□□□□ -0.41
YRF1-8P0CX22 YBL095WYBL095W 813 nt12.5□□□□□ -0.41
YRF1-8P0CX22 YKL053WYKL053W 375 nt12.48□□□□□ -0.41
YRF1-8P0CX22 KGD2YDR148C 1392 nt12.46□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 YER156CYER156C 1017 nt12.46□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 SRP54YPR088C 1626 nt12.45□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 TDH1YJL052W 999 nt12.45□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 RIM2YBR192W 1134 nt12.45□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 VPS62YGR141W 1404 nt12.44□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 MET1YKR069W 1782 nt12.43□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 RPS6AYPL090C 711 nt12.43□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 RPS6BYBR181C 711 nt12.43□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 URA1YKL216W 945 nt12.41□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 BXI1YNL305C 894 nt12.4□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 PBP1YGR178C 2169 nt12.4□□□□□ -0.42
YRF1-8P0CX22 NCA3YJL116C 1014 nt12.39□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 YML079WYML079W 606 nt12.38□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 RRT6YGL146C 936 nt12.36□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 SUV3YPL029W 2214 nt12.35□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 HAC1YFL031W 717 nt12.34□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 YIL168WYIL168W 384 nt12.34□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 YLR046CYLR046C 813 nt12.34□□□□□ -0.43
YRF1-8P0CX22 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt12.32□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 MAS2YHR024C 1449 nt12.31□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 YDL086WYDL086W 822 nt12.31□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 PUP2YGR253C 783 nt12.31□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 YPR084WYPR084W 1371 nt12.28□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 YJL144WYJL144W 315 nt12.28□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 YOR111WYOR111W 699 nt12.28□□□□□ -0.44
YRF1-8P0CX22 KEL3YPL263C 1956 nt12.27□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 ITR2YOL103W 1830 nt12.26□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 CAK1YFL029C 1107 nt12.25□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 YFR020WYFR020W 699 nt12.25□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 YPT11YNL304W 1254 nt12.25□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 SAN1YDR143C 1833 nt12.23□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 ILV3YJR016C 1758 nt12.23□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 CRC1YOR100C 984 nt12.23□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 ENT4YLL038C 744 nt12.22□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 OCH1YGL038C 1443 nt12.22□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 PTC6YCR079W 1329 nt12.21□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 RRT14YIL127C 621 nt12.21□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 CCT2YIL142W 1584 nt12.21□□□□□ -0.45
YRF1-8P0CX22 MET22YOL064C 1074 nt12.2□□□□□ -0.46
YRF1-8P0CX22 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt12.19□□□□□ -0.46
YRF1-8P0CX22 AVO2YMR068W 1281 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-8P0CX22 HAP5YOR358W 729 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-8P0CX22 BOR1YNL275W 1731 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-8P0CX22 DOC1YGL240W 753 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-8P0CX22 PIH1YHR034C 1035 nt12.14□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt12.14□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 OPI10YOL032W 741 nt12.14□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 CYS3YAL012W 1185 nt12.13□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 YMR265CYMR265C 1386 nt12.13□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 YDR476CYDR476C 675 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 VMA11YPL234C 495 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 snR31snR31 225 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 LAT1YNL071W 1449 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 SLM3YDL033C 1254 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 PUS4YNL292W 1212 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 RSM7YJR113C 744 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 LSR1LSR1 1175 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 DLD3YEL071W 1491 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 YOR325WYOR325W 474 nt12.09□□□□□ -0.47
YRF1-8P0CX22 CHS7YHR142W 951 nt12.08□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt12.05□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 GAS1YMR307W 1680 nt12.05□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 SHC1YER096W 1539 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 YOX1YML027W 1158 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 UME1YPL139C 1383 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 GAL83YER027C 1254 nt12.03□□□□□ -0.48
YRF1-8P0CX22 YHR219WYHR219W 1875 nt12.01□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 YLR460CYLR460C 1131 nt12.01□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 APT1YML022W 564 nt12.01□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 ATP23YNR020C 813 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 SPE3YPR069C 882 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 YAT1YAR035W 2064 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 PSP2YML017W 1782 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 POR2YIL114C 846 nt11.97□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 SPR1YOR190W 1338 nt11.97□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 YPT31YER031C 672 nt11.97□□□□□ -0.49
YRF1-8P0CX22 PDC6YGR087C 1692 nt11.96□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 ATP2YJR121W 1536 nt11.96□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 RPN14YGL004C 1254 nt11.93□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 ESBP6YNL125C 2022 nt11.93□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 YBL111CYBL111C 2004 nt11.93□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 PMP3YDR276C 168 nt11.92□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 RNA170RNA170 169 nt11.92□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 RHO1YPR165W 630 nt11.92□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 ZIM17YNL310C 525 nt11.9□□□□□ -0.5
YRF1-8P0CX22 SNX3YOR357C 489 nt11.89□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 PNS1YOR161C 1620 nt11.88□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 CPT1YNL130C 1182 nt11.86□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.86□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.86□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 CST26YBR042C 1194 nt11.84□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 GID8YMR135C 1368 nt11.84□□□□□ -0.51
YRF1-8P0CX22 MRS6YOR370C 1812 nt11.83□□□□□ -0.52
YRF1-8P0CX22 OLA1YBR025C 1185 nt11.82□□□□□ -0.52
YRF1-8P0CX22 THI73YLR004C 1572 nt11.81□□□□□ -0.52
YRF1-8P0CX22 PLB3YOL011W 2061 nt11.78□□□□□ -0.52
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