Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC22BO75396 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC22BO75396 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC22BO75396 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC22BO75396 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC22BO75396 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms