Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD5O14737 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD5O14737 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCD5O14737 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD5O14737 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD5O14737 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms