Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QLW9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QLW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QLW9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QLW9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QLW9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QLW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QLW9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QLW9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QLW9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QLW9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QLW9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QLW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QLW9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QLW9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QLW9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QLW9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QLW9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QLW9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QLW9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QLW9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QLW9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QLW9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QLW9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QLW9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QLW9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QLW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QLW9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QLW9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLW9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLW9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLW9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLW9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLW9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLW9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLW9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLW9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QLW9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QLW9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QLW9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QLW9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLW9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLW9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLW9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLW9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLW9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLW9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLW9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLW9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLW9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLW9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QLW9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QLW9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QLW9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLW9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLW9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLW9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLW9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLW9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLW9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLW9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLW9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLW9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QLW9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QLW9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLW9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QLW9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QLW9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QLW9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QLW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QLW9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QLW9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QLW9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QLW9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QLW9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms