Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KRW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KRW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KRW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KRW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KRW8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KRW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KRW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KRW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KRW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KRW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KRW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KRW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KRW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KRW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KRW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KRW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KRW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KRW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KRW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KRW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KRW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KRW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KRW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KRW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KRW8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KRW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KRW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KRW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KRW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KRW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KRW8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3KRW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3KRW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3KRW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
J3KRW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3KRW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
J3KRW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3KRW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KRW8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KRW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KRW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KRW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KRW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KRW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KRW8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KRW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KRW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KRW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KRW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KRW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KRW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KRW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KRW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KRW8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KRW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KRW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KRW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms