Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC188H7C350 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC188H7C350 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC188H7C350 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms