Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGTLC3B5MD39 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGTLC3B5MD39 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGTLC3B5MD39 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GGTLC3B5MD39 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GGTLC3B5MD39 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GGTLC3B5MD39 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGTLC3B5MD39 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGTLC3B5MD39 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGTLC3B5MD39 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms