Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM2BA6NLU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM2BA6NLU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSTM2BA6NLU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSTM2BA6NLU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM2BA6NLU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM2BA6NLU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms