Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTI8

TMEM272, Transmembrane protein 272, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM272A0A1B0GTI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM272A0A1B0GTI8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM272A0A1B0GTI8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM272A0A1B0GTI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM272A0A1B0GTI8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms