Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms