Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 KAP122YGL016W 3246 nt1.9□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 SEC21YNL287W 2808 nt1.9□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 GLG1YKR058W 1851 nt1.9□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 PKH3YDR466W 2697 nt1.9□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 WAR1YML076C 2835 nt1.9□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 MSH3YCR092C 3057 nt1.88□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 AZF1YOR113W 2745 nt1.88□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 PEP1YBL017C 4740 nt1.88□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 EMC5YIL027C 426 nt1.87□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 ORC3YLL004W 1851 nt1.86□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 UBP3YER151C 2739 nt1.86□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.86□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 MON2YNL297C 4911 nt1.86□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 NOP9YJL010C 2001 nt1.86□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 RPM2YML091C 3609 nt1.86□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 SKI3YPR189W 4299 nt1.85□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 RPL26BYGR034W 384 nt1.85□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 RAD50YNL250W 3939 nt1.85□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.84□□□□□ -2.11
NSI1Q12457 KIP1YBL063W 3336 nt1.84□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.83□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 MMS4YBR098W 2076 nt1.83□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 snR190snR190 190 nt1.83□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 CHS1YNL192W 3396 nt1.83□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 NNF2YGR089W 2811 nt1.83□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 FAB1YFR019W 6837 nt1.82□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 MYO2YOR326W 4725 nt1.82□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 YOR093CYOR093C 4947 nt1.81□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 YLR422WYLR422W 5799 nt1.81□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.8□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 SEC3YER008C 4011 nt1.8□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 PIK1YNL267W 3201 nt1.79□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 ANS1YHR126C 480 nt1.79□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 snR53snR53 91 nt1.79□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 IRC20YLR247C 4671 nt1.79□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 SMC4YLR086W 4257 nt1.78□□□□□ -2.12
NSI1Q12457 STO1YMR125W 2586 nt1.76□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.75□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 PMD1YER132C 5262 nt1.75□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.74□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.73□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 SEC10YLR166C 2616 nt1.72□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 DNF3YMR162C 4971 nt1.72□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 APL3YBL037W 3078 nt1.72□□□□□ -2.13
NSI1Q12457 ROM2YLR371W 4071 nt1.71□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 CDC39YCR093W 6327 nt1.7□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 MYO1YHR023W 5787 nt1.7□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 snR47snR47 99 nt1.7□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 BRR2YER172C 6492 nt1.7□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 ULP2YIL031W 3105 nt1.7□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 SMC1YFL008W 3678 nt1.7□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.69□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.69□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 PRP16YKR086W 3216 nt1.69□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 IRA1YBR140C 9279 nt1.68□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 CFT1YDR301W 4074 nt1.68□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 snR64snR64 101 nt1.67□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.67□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 GEA2YEL022W 4380 nt1.66□□□□□ -2.14
NSI1Q12457 FIG2YCR089W 4830 nt1.65□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 VPS15YBR097W 4365 nt1.64□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 SWI4YER111C 3282 nt1.64□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 SXM1YDR395W 2835 nt1.64□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 NUP192YJL039C 5052 nt1.64□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 NUP188YML103C 4968 nt1.63□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 MEC1YBR136W 7107 nt1.63□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 BST1YFL025C 3090 nt1.63□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.62□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.61□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 NST1YNL091W 3723 nt1.61□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 MSN5YDR335W 3675 nt1.6□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 SSK2YNR031C 4740 nt1.6□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.59□□□□□ -2.15
NSI1Q12457 SEC8YPR055W 3198 nt1.57□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 CLU1YMR012W 3834 nt1.57□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.56□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 EST1YLR233C 2100 nt1.56□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 CDC25YLR310C 4770 nt1.55□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 NUP145YGL092W 3954 nt1.55□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 EST2YLR318W 2655 nt1.54□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 PET127YOR017W 2403 nt1.53□□□□□ -2.16
NSI1Q12457 YKL225WYKL225W 348 nt1.52□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.52□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 LAA1YJL207C 6045 nt1.51□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 CAT8YMR280C 4302 nt1.5□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 snR69snR69 101 nt1.49□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.49□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 snR38snR38 95 nt1.49□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 SPC110YDR356W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 YSP1YHR155W 3687 nt1.49□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.48□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 CCH1YGR217W 6120 nt1.47□□□□□ -2.17
NSI1Q12457 AI1Q0050 2505 nt1.46□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 CSE1YGL238W 2883 nt1.46□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 FYV8YGR196C 2454 nt1.46□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 BUD3YCL014W 4911 nt1.45□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.44□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 snR50snR50 90 nt1.44□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.1 ms