Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.36□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 YSP2YDR326C 4317 nt3.35□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 UTP22YGR090W 3714 nt3.35□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt3.35□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 PSD2YGR170W 3417 nt3.34□□□□□ -1.87
DIP2Q12220 AXL1YPR122W 3627 nt3.33□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 KCS1YDR017C 3153 nt3.33□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt3.32□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 MOT1YPL082C 5604 nt3.32□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 CSE1YGL238W 2883 nt3.32□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 ESC1YMR219W 4977 nt3.31□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3.31□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 SEC7YDR170C 6030 nt3.31□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 SMC4YLR086W 4257 nt3.29□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 MSN5YDR335W 3675 nt3.29□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt3.29□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 UBP2YOR124C 3819 nt3.28□□□□□ -1.88
DIP2Q12220 YOR055WYOR055W 435 nt3.27□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 IRC20YLR247C 4671 nt3.27□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 SEC31YDL195W 3822 nt3.26□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 SKI3YPR189W 4299 nt3.26□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 SCD5YOR329C 2619 nt3.26□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 MYO4YAL029C 4416 nt3.26□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 GEA2YEL022W 4380 nt3.26□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 APL3YBL037W 3078 nt3.25□□□□□ -1.89
DIP2Q12220 CAT8YMR280C 4302 nt3.21□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YER138CYER138C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YER160CYER160C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YJR027WYJR027W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YML039WYML039W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YML045WYML045W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YMR050CYMR050C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.2□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt3.19□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 TOM1YDR457W 9807 nt3.17□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 BNR1YIL159W 4128 nt3.17□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 HUG1YML058W-A 207 nt3.16□□□□□ -1.9
DIP2Q12220 PDR11YIL013C 4236 nt3.15□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 PET111YMR257C 2403 nt3.14□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 MSH3YCR092C 3057 nt3.13□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 FKS3YMR306W 5358 nt3.13□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 UBR2YLR024C 5619 nt3.12□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 SWI4YER111C 3282 nt3.12□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 ATG9YDL149W 2994 nt3.11□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 NUP145YGL092W 3954 nt3.09□□□□□ -1.91
DIP2Q12220 YLR419WYLR419W 4308 nt3.08□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 CYR1YJL005W 6081 nt3.08□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 SIP4YJL089W 2490 nt3.08□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 SGS1YMR190C 4344 nt3.07□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 MSB1YOR188W 3414 nt3.06□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 PDR1YGL013C 3207 nt3.04□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 EST2YLR318W 2655 nt3.04□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 PAU12YGR294W 363 nt3.04□□□□□ -1.92
DIP2Q12220 BUL2YML111W 2763 nt3.02□□□□□ -1.93
DIP2Q12220 REV3YPL167C 4515 nt3□□□□□ -1.93
DIP2Q12220 CLU1YMR012W 3834 nt2.98□□□□□ -1.93
DIP2Q12220 BCK1YJL095W 4437 nt2.97□□□□□ -1.93
DIP2Q12220 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.96□□□□□ -1.94
DIP2Q12220 FYV8YGR196C 2454 nt2.93□□□□□ -1.94
DIP2Q12220 IRA2YOL081W 9240 nt2.91□□□□□ -1.94
DIP2Q12220 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.91□□□□□ -1.94
DIP2Q12220 ECM29YHL030W 5607 nt2.9□□□□□ -1.94
DIP2Q12220 MLP2YIL149C 5040 nt2.87□□□□□ -1.95
DIP2Q12220 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.85□□□□□ -1.95
DIP2Q12220 NUM1YDR150W 8247 nt2.84□□□□□ -1.95
DIP2Q12220 NUP170YBL079W 4509 nt2.84□□□□□ -1.96
DIP2Q12220 BNI1YNL271C 5862 nt2.83□□□□□ -1.96
DIP2Q12220 TRA1YHR099W 11235 nt2.81□□□□□ -1.96
DIP2Q12220 TRM732YMR259C 4263 nt2.79□□□□□ -1.96
DIP2Q12220 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.79□□□□□ -1.96
DIP2Q12220 BPH1YCR032W 6504 nt2.77□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 YOL098CYOL098C 3114 nt2.77□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 NEO1YIL048W 3456 nt2.75□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 USO1YDL058W 5373 nt2.73□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 BST1YFL025C 3090 nt2.73□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 NUP188YML103C 4968 nt2.73□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 SEC16YPL085W 6588 nt2.73□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 TMA7YLR262C-A 195 nt2.73□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 TOR1YJR066W 7413 nt2.72□□□□□ -1.97
DIP2Q12220 TOR2YKL203C 7425 nt2.71□□□□□ -1.98
DIP2Q12220 MON2YNL297C 4911 nt2.71□□□□□ -1.98
DIP2Q12220 CDC39YCR093W 6327 nt2.67□□□□□ -1.98
DIP2Q12220 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt2.66□□□□□ -1.98
DIP2Q12220 NUP192YJL039C 5052 nt2.64□□□□□ -1.99
DIP2Q12220 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt2.62□□□□□ -1.99
DIP2Q12220 PMD1YER132C 5262 nt2.61□□□□□ -1.99
DIP2Q12220 LAA1YJL207C 6045 nt2.61□□□□□ -1.99
DIP2Q12220 VPS13YLL040C 9435 nt2.59□□□□□ -2
DIP2Q12220 CSF1YLR087C 8877 nt2.58□□□□□ -2
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