Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 TFC3YAL001C 3483 nt2.66□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 SEC16YPL085W 6588 nt2.66□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 KIP1YBL063W 3336 nt2.65□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 SMC4YLR086W 4257 nt2.64□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 EMC5YIL027C 426 nt2.64□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 RPM2YML091C 3609 nt2.64□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 SSD1YDR293C 3753 nt2.64□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 GEA2YEL022W 4380 nt2.63□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 MYO4YAL029C 4416 nt2.63□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 RAD9YDR217C 3930 nt2.62□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 NNF2YGR089W 2811 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 UBP3YER151C 2739 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 HER1YOR227W 3741 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 STH1YIL126W 4080 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 SIR4YDR227W 4077 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 YDL073WYDL073W 2955 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP53Q12080 BNI1YNL271C 5862 nt2.58□□□□□ -2
NOP53Q12080 CHS1YNL192W 3396 nt2.57□□□□□ -2
NOP53Q12080 STO1YMR125W 2586 nt2.56□□□□□ -2
NOP53Q12080 NEO1YIL048W 3456 nt2.56□□□□□ -2
NOP53Q12080 YKL225WYKL225W 348 nt2.56□□□□□ -2
NOP53Q12080 BEM3YPL115C 3387 nt2.53□□□□□ -2
NOP53Q12080 KAP122YGL016W 3246 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 TOR2YKL203C 7425 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 ANS1YHR126C 480 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 BRE1YDL074C 2103 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.49□□□□□ -2.01
NOP53Q12080 TDA9YML081W 3756 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 PEP1YBL017C 4740 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 PRP16YKR086W 3216 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 SPP41YDR464W 4308 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 SAC3YDR159W 3906 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 MON2YNL297C 4911 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 SEC31YDL195W 3822 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 MGA2YIR033W 3342 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 DGR1YNL130C-A 147 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP53Q12080 FAB1YFR019W 6837 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 EST1YLR233C 2100 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 PKH3YDR466W 2697 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 SKI3YPR189W 4299 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 snR75snR75 89 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 PMD1YER132C 5262 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 APL3YBL037W 3078 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 YOR093CYOR093C 4947 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 ATG9YDL149W 2994 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 YLR422WYLR422W 5799 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 FKS1YLR342W 5631 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 SEC8YPR055W 3198 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 ROM2YLR371W 4071 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP53Q12080 PET127YOR017W 2403 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 snR69snR69 101 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 KCS1YDR017C 3153 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 IRC20YLR247C 4671 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 RPL41AYDL184C 78 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 SEC3YER008C 4011 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 SXM1YDR395W 2835 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 CSE1YGL238W 2883 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP53Q12080 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 YSP1YHR155W 3687 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 snR38snR38 95 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 SWI4YER111C 3282 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 TMA7YLR262C-A 195 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 TRM732YMR259C 4263 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 RDS3YPR094W 324 nt2.24□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 ULP2YIL031W 3105 nt2.24□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 SKI7YOR076C 2244 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 YCS4YLR272C 3531 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP53Q12080 AI1Q0050 2505 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 NUP188YML103C 4968 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 MSH3YCR092C 3057 nt2.19□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 VPS15YBR097W 4365 nt2.19□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.19□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 NUP192YJL039C 5052 nt2.18□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 HUG1YML058W-A 207 nt2.18□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.17□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 NUP145YGL092W 3954 nt2.16□□□□□ -2.06
NOP53Q12080 CFT1YDR301W 4074 nt2.14□□□□□ -2.07
NOP53Q12080 NIP1YMR309C 2439 nt2.11□□□□□ -2.07
NOP53Q12080 MYO1YHR023W 5787 nt2.11□□□□□ -2.07
NOP53Q12080 SSK2YNR031C 4740 nt2.1□□□□□ -2.07
NOP53Q12080 PAU12YGR294W 363 nt2.09□□□□□ -2.07
NOP53Q12080 CDC39YCR093W 6327 nt2.09□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 CDC25YLR310C 4770 nt2.08□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 BRR2YER172C 6492 nt2.07□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 DNF3YMR162C 4971 nt2.07□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 MSN5YDR335W 3675 nt2.07□□□□□ -2.08
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