Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.33□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 MSH6YDR097C 3729 nt2.32□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 SCD5YOR329C 2619 nt2.32□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.32□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.3□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 VPS13YLL040C 9435 nt2.3□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 KRE33YNL132W 3171 nt2.29□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 HSL1YKL101W 4557 nt2.29□□□□□ -2.04
BUD20Q08004 KOG1YHR186C 4674 nt2.27□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 AI1Q0050 2505 nt2.27□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 PRP16YKR086W 3216 nt2.27□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 EST1YLR233C 2100 nt2.27□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 TFC3YAL001C 3483 nt2.27□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 SPF1YEL031W 3648 nt2.26□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 YLR422WYLR422W 5799 nt2.26□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 snR38snR38 95 nt2.26□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 HER1YOR227W 3741 nt2.26□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 DNF1YER166W 4716 nt2.26□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 snR69snR69 101 nt2.25□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 IRA2YOL081W 9240 nt2.25□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 PET127YOR017W 2403 nt2.25□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 PSD2YGR170W 3417 nt2.24□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 STH1YIL126W 4080 nt2.24□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 snR14snR14 160 nt2.24□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 STO1YMR125W 2586 nt2.23□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 SAC3YDR159W 3906 nt2.23□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 SXM1YDR395W 2835 nt2.23□□□□□ -2.05
BUD20Q08004 NIP1YMR309C 2439 nt2.21□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 GEA2YEL022W 4380 nt2.21□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 RDS3YPR094W 324 nt2.21□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 SEC8YPR055W 3198 nt2.21□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 PKH3YDR466W 2697 nt2.2□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 CDC25YLR310C 4770 nt2.2□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 YSP1YHR155W 3687 nt2.2□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 ULP2YIL031W 3105 nt2.2□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 SMC4YLR086W 4257 nt2.19□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 MYO4YAL029C 4416 nt2.19□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 INO80YGL150C 4470 nt2.18□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 UTP22YGR090W 3714 nt2.18□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 KAP122YGL016W 3246 nt2.17□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 CSE1YGL238W 2883 nt2.17□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 SIR4YDR227W 4077 nt2.16□□□□□ -2.06
BUD20Q08004 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.15□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 YOL098CYOL098C 3114 nt2.15□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 APL3YBL037W 3078 nt2.14□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 YCS4YLR272C 3531 nt2.14□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.14□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 NUP170YBL079W 4509 nt2.13□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 DGR1YNL130C-A 147 nt2.12□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 UBR2YLR024C 5619 nt2.1□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 SEC3YER008C 4011 nt2.09□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 CSF1YLR087C 8877 nt2.09□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 HUG1YML058W-A 207 nt2.09□□□□□ -2.07
BUD20Q08004 BNI1YNL271C 5862 nt2.08□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 PET111YMR257C 2403 nt2.08□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 MSN5YDR335W 3675 nt2.07□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 SKI3YPR189W 4299 nt2.07□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 IRC20YLR247C 4671 nt2.06□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.06□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.06□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 BPH1YCR032W 6504 nt2.06□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 NST1YNL091W 3723 nt2.05□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 YLR419WYLR419W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 KCS1YDR017C 3153 nt2.04□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 SPP41YDR464W 4308 nt2.03□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 SEC16YPL085W 6588 nt2.03□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 MSH3YCR092C 3057 nt2.03□□□□□ -2.08
BUD20Q08004 UBP2YOR124C 3819 nt2.02□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 SEC31YDL195W 3822 nt2.02□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 SIP4YJL089W 2490 nt2□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 CAT8YMR280C 4302 nt2□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 PAU12YGR294W 363 nt1.99□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 SWI4YER111C 3282 nt1.99□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 EST2YLR318W 2655 nt1.98□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 NUP145YGL092W 3954 nt1.97□□□□□ -2.09
BUD20Q08004 BUL2YML111W 2763 nt1.96□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 ATG9YDL149W 2994 nt1.96□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.96□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 NEO1YIL048W 3456 nt1.95□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 USO1YDL058W 5373 nt1.95□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.94□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 FYV8YGR196C 2454 nt1.94□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 TOR2YKL203C 7425 nt1.9□□□□□ -2.1
BUD20Q08004 FKS1YLR342W 5631 nt1.89□□□□□ -2.11
BUD20Q08004 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.87□□□□□ -2.11
BUD20Q08004 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.86□□□□□ -2.11
BUD20Q08004 YMR045CYMR045C 5268 nt1.84□□□□□ -2.11
BUD20Q08004 MON2YNL297C 4911 nt1.82□□□□□ -2.12
BUD20Q08004 PEP1YBL017C 4740 nt1.81□□□□□ -2.12
BUD20Q08004 NUP188YML103C 4968 nt1.79□□□□□ -2.12
BUD20Q08004 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.79□□□□□ -2.12
BUD20Q08004 PMD1YER132C 5262 nt1.78□□□□□ -2.12
BUD20Q08004 BST1YFL025C 3090 nt1.76□□□□□ -2.13
BUD20Q08004 TMA7YLR262C-A 195 nt1.76□□□□□ -2.13
BUD20Q08004 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.75□□□□□ -2.13
BUD20Q08004 TRM732YMR259C 4263 nt1.75□□□□□ -2.13
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