Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 CBS1YDL069C 690 nt-1.24□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 YAR047CYAR047C 321 nt-1.24□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.25□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 snR49snR49 165 nt-1.25□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 VPS20YMR077C 666 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 RPS27BYHR021C 249 nt-1.27□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 APQ12YIL040W 417 nt-1.29□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 YGL052WYGL052W 306 nt-1.3□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 YAL066WYAL066W 309 nt-1.31□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 YLR269CYLR269C 351 nt-1.31□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 PRM3YPL192C 402 nt-1.31□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 YGR069WYGR069W 336 nt-1.32□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 GPI15YNL038W 690 nt-1.33□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 CSE2YNR010W 450 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-2P40105 TOM22YNL131W 459 nt-1.36□□□□□ -2.63
YRF1-2P40105 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.38□□□□□ -2.63
YRF1-2P40105 snR189snR189 189 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRF1-2P40105 snR54snR54 86 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRF1-2P40105 YHR125WYHR125W 306 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRF1-2P40105 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRF1-2P40105 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.42□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-1.42□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YOR170WYOR170W 306 nt-1.42□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YBR285WYBR285W 435 nt-1.43□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.45□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.45□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.45□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YAF9YNL107W 681 nt-1.45□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-1.45□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YDR544CYDR544C 429 nt-1.46□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YER006C-AYER006C-A 318 nt-1.47□□□□□ -2.64
YRF1-2P40105 YOR121CYOR121C 306 nt-1.48□□□□□ -2.65
YRF1-2P40105 YGL149WYGL149W 306 nt-1.49□□□□□ -2.65
YRF1-2P40105 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.49□□□□□ -2.65
YRF1-2P40105 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.5□□□□□ -2.65
YRF1-2P40105 EAF6YJR082C 342 nt-1.51□□□□□ -2.65
YRF1-2P40105 snR74snR74 88 nt-1.51□□□□□ -2.65
YRF1-2P40105 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.55□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-1.55□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 SKI7YOR076C 2244 nt-1.56□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 JLP2YMR132C 627 nt-1.56□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 CSN9YDR179C 489 nt-1.57□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.57□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 YNL266WYNL266W 420 nt-1.58□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 BI2Q0110 1272 nt-1.58□□□□□ -2.66
YRF1-2P40105 HMRA1YCR097W 381 nt-1.6□□□□□ -2.67
YRF1-2P40105 MPC1YGL080W 393 nt-1.61□□□□□ -2.67
YRF1-2P40105 YER137W-AYER137W-A 306 nt-1.61□□□□□ -2.67
YRF1-2P40105 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.64□□□□□ -2.67
YRF1-2P40105 YDL158CYDL158C 309 nt-1.67□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 snR81snR81 201 nt-1.7□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.7□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 snR50snR50 90 nt-1.7□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 Q0255Q0255 1419 nt-1.71□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.71□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 STE18YJR086W 333 nt-1.71□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 snR69snR69 101 nt-1.72□□□□□ -2.68
YRF1-2P40105 RDS3YPR094W 324 nt-1.73□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 snR77snR77 88 nt-1.74□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 YDR102CYDR102C 333 nt-1.74□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 YDR048CYDR048C 315 nt-1.76□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-1.76□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.77□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 YLR434CYLR434C 384 nt-1.77□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 snR60snR60 104 nt-1.77□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 YNL028WYNL028W 318 nt-1.77□□□□□ -2.69
YRF1-2P40105 YNL205CYNL205C 423 nt-1.79□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YKL123WYKL123W 381 nt-1.8□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 snR41snR41 95 nt-1.8□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-1.8□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 snR67snR67 82 nt-1.81□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.81□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.81□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YFL032WYFL032W 321 nt-1.82□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YNL324WYNL324W 396 nt-1.82□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YER097WYER097W 330 nt-1.84□□□□□ -2.7
YRF1-2P40105 YNL122CYNL122C 348 nt-1.85□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.85□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 YLR202CYLR202C 327 nt-1.86□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.87□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-1.88□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.89□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.9□□□□□ -2.71
YRF1-2P40105 YFL019CYFL019C 354 nt-1.91□□□□□ -2.72
YRF1-2P40105 ATP6Q0085 780 nt-1.92□□□□□ -2.72
YRF1-2P40105 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-1.93□□□□□ -2.72
YRF1-2P40105 snR39BsnR39B 96 nt-1.94□□□□□ -2.72
YRF1-2P40105 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-1.96□□□□□ -2.72
YRF1-2P40105 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-1.96□□□□□ -2.72
YRF1-2P40105 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-1.97□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-1.98□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-1.98□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 BIL1YOR304C-A 231 nt-1.99□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 HTL1YCR020W-B 237 nt-1.99□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.01□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-2.02□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.02□□□□□ -2.73
YRF1-2P40105 YKL063CYKL063C 504 nt-2.03□□□□□ -2.73
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