Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NECAP2Q9NVZ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms