Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNPLA3Q9NST1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNPLA3Q9NST1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms