Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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