Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1CQ15572 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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