Protein–RNA interactions for Protein: Q12372

MMP1, S-methylmethionine permease 1, yeastyeast

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMP1Q12372 MMS4YBR098W 2076 nt2.54□□□□□ -2
MMP1Q12372 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.53□□□□□ -2
MMP1Q12372 SEC1YDR164C 2175 nt2.52□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 EMC5YIL027C 426 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YER138CYER138C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YER160CYER160C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YJR027WYJR027W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YML039WYML039W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YML045WYML045W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YMR050CYMR050C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 ROM2YLR371W 4071 nt2.51□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YLR232WYLR232W 348 nt2.5□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YCS4YLR272C 3531 nt2.5□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 PSD2YGR170W 3417 nt2.5□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 YAR009CYAR009C 3591 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 GYP5YPL249C 2685 nt2.49□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 PDR8YLR266C 2106 nt2.48□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 SVL3YPL032C 2478 nt2.48□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 SEC21YNL287W 2808 nt2.47□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 AXL1YPR122W 3627 nt2.47□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 CSF1YLR087C 8877 nt2.47□□□□□ -2.01
MMP1Q12372 RAD50YNL250W 3939 nt2.46□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 HER1YOR227W 3741 nt2.46□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 YLR422WYLR422W 5799 nt2.45□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 KIP1YBL063W 3336 nt2.45□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 DNA2YHR164C 4569 nt2.45□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 FYV10YIL097W 1551 nt2.44□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 RGA1YOR127W 3024 nt2.44□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.44□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 SMC1YFL008W 3678 nt2.43□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 HSL1YKL101W 4557 nt2.43□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.43□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 UFD4YKL010C 4452 nt2.42□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 TOR1YJR066W 7413 nt2.42□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 INO80YGL150C 4470 nt2.42□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 NOP9YJL010C 2001 nt2.41□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 NUP157YER105C 4176 nt2.41□□□□□ -2.02
MMP1Q12372 NUM1YDR150W 8247 nt2.4□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 SLX4YLR135W 2247 nt2.4□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.39□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 KCS1YDR017C 3153 nt2.39□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 SPF1YEL031W 3648 nt2.37□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 snR190snR190 190 nt2.36□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 TRA1YHR099W 11235 nt2.36□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 KOG1YHR186C 4674 nt2.35□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 SEC31YDL195W 3822 nt2.35□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 PDR1YGL013C 3207 nt2.34□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 snR70snR70 164 nt2.34□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt2.34□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 RPL26BYGR034W 384 nt2.34□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 CDC25YLR310C 4770 nt2.34□□□□□ -2.03
MMP1Q12372 SLN1YIL147C 3663 nt2.33□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 YDL073WYDL073W 2955 nt2.33□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 ATG9YDL149W 2994 nt2.33□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 FKS3YMR306W 5358 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 SKI3YPR189W 4299 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 YOR055WYOR055W 435 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 snR14snR14 160 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 MYO4YAL029C 4416 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 KAP122YGL016W 3246 nt2.32□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 SGS1YMR190C 4344 nt2.31□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 UBR2YLR024C 5619 nt2.31□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 VPS13YLL040C 9435 nt2.3□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 RPS26AYGL189C 360 nt2.3□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.3□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 WAR1YML076C 2835 nt2.29□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 ASE1YOR058C 2658 nt2.28□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 CHS1YNL192W 3396 nt2.28□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 STH1YIL126W 4080 nt2.28□□□□□ -2.04
MMP1Q12372 SET3YKR029C 2256 nt2.27□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 SMC4YLR086W 4257 nt2.27□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 STO1YMR125W 2586 nt2.27□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 YLR419WYLR419W 4308 nt2.26□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 MGA2YIR033W 3342 nt2.26□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.26□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 ARP8YOR141C 2646 nt2.26□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 YOL098CYOL098C 3114 nt2.24□□□□□ -2.05
MMP1Q12372 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112.2 ms