Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 CSN9YDR179C 489 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YAR053WYAR053W 297 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YMR321CYMR321C 318 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YNL211CYNL211C 261 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 LEE1YPL054W 906 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 BIR1YJR089W 2865 nt0.53□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.52□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 HTB2YBL002W 396 nt0.52□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.51□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 STE5YDR103W 2754 nt0.5□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 BIL1YOR304C-A 231 nt0.5□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 INA22YIR024C 651 nt0.49□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.49□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 TAR1YLR154W-C 375 nt0.49□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 COX5BYIL111W 456 nt0.48□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.48□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 YMR160WYMR160W 2451 nt0.47□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 PET111YMR257C 2403 nt0.47□□□□□ -2.33
NFI1Q12216 PRP5YBR237W 2550 nt0.46□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.46□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 VIK1YPL253C 1944 nt0.45□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.45□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.45□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 SGF11YPL047W 300 nt0.45□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 RPL35AYDL191W 363 nt0.44□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 YGR035CYGR035C 351 nt0.44□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 Q0144Q0144 330 nt0.44□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 OST4YDL232W 111 nt0.43□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 snR190snR190 190 nt0.42□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 PRP42YDR235W 1635 nt0.42□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.41□□□□□ -2.34
NFI1Q12216 SBH1YER087C-B 249 nt0.4□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 YOR029WYOR029W 336 nt0.39□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 PAU12YGR294W 363 nt0.38□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 CSE2YNR010W 450 nt0.38□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 ULP2YIL031W 3105 nt0.38□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.37□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 SSS1YDR086C 243 nt0.36□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 YDR157WYDR157W 402 nt0.36□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 RPS27BYHR021C 249 nt0.36□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 RPS30BYOR182C 192 nt0.36□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.36□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 ABF2YMR072W 552 nt0.35□□□□□ -2.35
NFI1Q12216 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.34□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YDR048CYDR048C 315 nt0.34□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 STF2YGR008C 255 nt0.34□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 COG8YML071C 1824 nt0.32□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 VAR1Q0140 1197 nt0.3□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YKL136WYKL136W 399 nt0.3□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.29□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 THO2YNL139C 4794 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 AI1Q0050 2505 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YLR282CYLR282C 342 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 NNF2YGR089W 2811 nt0.28□□□□□ -2.36
NFI1Q12216 YCR022CYCR022C 345 nt0.27□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.27□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.27□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 YOR345CYOR345C 351 nt0.27□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.26□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.26□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 HUG1YML058W-A 207 nt0.24□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 HTL1YCR020W-B 237 nt0.23□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.23□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 BLI1YKL061W 342 nt0.22□□□□□ -2.37
NFI1Q12216 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.21□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 ULI1YFR026C 510 nt0.21□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 RPS26AYGL189C 360 nt0.21□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.2□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.2□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 NIP1YMR309C 2439 nt0.2□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 ESP1YGR098C 4893 nt0.2□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.19□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 COY1YKL179C 2040 nt0.18□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.18□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.17□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YNL146WYNL146W 303 nt0.17□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 ORC3YLL004W 1851 nt0.16□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 snR60snR60 104 nt0.16□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YIL032CYIL032C 357 nt0.16□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YLR041WYLR041W 321 nt0.16□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 YPR092WYPR092W 306 nt0.16□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 RCO1YMR075W 2055 nt0.15□□□□□ -2.38
NFI1Q12216 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.15□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YFL063WYFL063W 456 nt0.15□□□□□ -2.39
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