Protein–RNA interactions for Protein: P53830

CUS2, Cold sensitive U2 snRNA suppressor 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUS2P53830 RPS25BYLR333C 327 nt0.21□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.21□□□□□ -2.38
CUS2P53830 BIR1YJR089W 2865 nt0.2□□□□□ -2.38
CUS2P53830 UTP20YBL004W 7482 nt0.2□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YOR345CYOR345C 351 nt0.2□□□□□ -2.38
CUS2P53830 LEE1YPL054W 906 nt0.2□□□□□ -2.38
CUS2P53830 ORC3YLL004W 1851 nt0.2□□□□□ -2.38
CUS2P53830 MLP2YIL149C 5040 nt0.2□□□□□ -2.38
CUS2P53830 HMRA2YCR096C 360 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 OST4YDL232W 111 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YJL120WYJL120W 324 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 VPS20YMR077C 666 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YPL205CYPL205C 345 nt0.19□□□□□ -2.38
CUS2P53830 PRP42YDR235W 1635 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 SSS1YDR086C 243 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YHR138CYHR138C 345 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YJL007CYJL007C 315 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YBR285WYBR285W 435 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 VIK1YPL253C 1944 nt0.18□□□□□ -2.38
CUS2P53830 SEC8YPR055W 3198 nt0.17□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YER079WYER079W 633 nt0.17□□□□□ -2.38
CUS2P53830 PRM3YPL192C 402 nt0.17□□□□□ -2.38
CUS2P53830 snR190snR190 190 nt0.17□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.17□□□□□ -2.38
CUS2P53830 STE5YDR103W 2754 nt0.17□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
CUS2P53830 RPL35AYDL191W 363 nt0.15□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.15□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.15□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YLR202CYLR202C 327 nt0.15□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YPR092WYPR092W 306 nt0.15□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.14□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.14□□□□□ -2.39
CUS2P53830 AI1Q0050 2505 nt0.14□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YAR053WYAR053W 297 nt0.13□□□□□ -2.39
CUS2P53830 HAL9YOL089C 3093 nt0.13□□□□□ -2.39
CUS2P53830 TRS65YGR166W 1683 nt0.12□□□□□ -2.39
CUS2P53830 RPS26AYGL189C 360 nt0.12□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.12□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.12□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.12□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YDR048CYDR048C 315 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 AGA2YGL032C 264 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 HTB2YBL002W 396 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YOR121CYOR121C 306 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.11□□□□□ -2.39
CUS2P53830 YKL063CYKL063C 504 nt0.1□□□□□ -2.39
CUS2P53830 COG8YML071C 1824 nt0.1□□□□□ -2.39
CUS2P53830 NNF2YGR089W 2811 nt0.09□□□□□ -2.39
CUS2P53830 RCO1YMR075W 2055 nt0.09□□□□□ -2.39
CUS2P53830 ULI1YFR026C 510 nt0.09□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YNL146WYNL146W 303 nt0.09□□□□□ -2.4
CUS2P53830 COY1YKL179C 2040 nt0.09□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.08□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.08□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YKL136WYKL136W 399 nt0.07□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YLR282CYLR282C 342 nt0.07□□□□□ -2.4
CUS2P53830 Q0017Q0017 162 nt0.06□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.04□□□□□ -2.4
CUS2P53830 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.04□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YNL324WYNL324W 396 nt0.04□□□□□ -2.4
CUS2P53830 NIP1YMR309C 2439 nt0.03□□□□□ -2.4
CUS2P53830 YCR022CYCR022C 345 nt0.02□□□□□ -2.41
CUS2P53830 RPS27BYHR021C 249 nt0.02□□□□□ -2.41
CUS2P53830 snR60snR60 104 nt0.01□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.01□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.01□□□□□ -2.41
CUS2P53830 BIL1YOR304C-A 231 nt0.01□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YOL014WYOL014W 375 nt0□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.01□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.02□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.02□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YEL073CYEL073C 324 nt-0.03□□□□□ -2.41
CUS2P53830 CSE2YNR010W 450 nt-0.03□□□□□ -2.41
CUS2P53830 YGR035CYGR035C 351 nt-0.04□□□□□ -2.42
CUS2P53830 YKU70YMR284W 1809 nt-0.04□□□□□ -2.42
CUS2P53830 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.05□□□□□ -2.42
CUS2P53830 BUL2YML111W 2763 nt-0.05□□□□□ -2.42
CUS2P53830 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.06□□□□□ -2.42
CUS2P53830 SNU13YEL026W 381 nt-0.06□□□□□ -2.42
CUS2P53830 BLI1YKL061W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
CUS2P53830 THO2YNL139C 4794 nt-0.06□□□□□ -2.42
CUS2P53830 QCR9YGR183C 201 nt-0.07□□□□□ -2.42
CUS2P53830 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.07□□□□□ -2.42
CUS2P53830 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.08□□□□□ -2.42
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