Protein–RNA interactions for Protein: P36527

MRPL28, 54S ribosomal protein L28, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL28P36527 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 PCC1YKR095W-A 267 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YMR321CYMR321C 318 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YPL225WYPL225W 441 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 PRP42YDR235W 1635 nt0.19□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 HMRA2YCR096C 360 nt0.18□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 COX5BYIL111W 456 nt0.18□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YJL120WYJL120W 324 nt0.18□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.18□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 SGF11YPL047W 300 nt0.18□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 RPS25BYLR333C 327 nt0.17□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YOR345CYOR345C 351 nt0.17□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 AI1Q0050 2505 nt0.16□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
MRPL28P36527 CSN9YDR179C 489 nt0.14□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 TRS65YGR166W 1683 nt0.14□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 snR190snR190 190 nt0.13□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 ORC3YLL004W 1851 nt0.13□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.12□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 VPS20YMR077C 666 nt0.12□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.11□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 RCO1YMR075W 2055 nt0.1□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 MLP2YIL149C 5040 nt0.1□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.1□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 YAR029WYAR029W 225 nt0.1□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 MYO1YHR023W 5787 nt0.1□□□□□ -2.39
MRPL28P36527 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.09□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 RPS26AYGL189C 360 nt0.09□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YJL007CYJL007C 315 nt0.09□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.08□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 LEE1YPL054W 906 nt0.08□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 IQG1YPL242C 4488 nt0.07□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YHR138CYHR138C 345 nt0.07□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.07□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YOL014WYOL014W 375 nt0.07□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 NNF2YGR089W 2811 nt0.06□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 BIR1YJR089W 2865 nt0.06□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YNL146WYNL146W 303 nt0.06□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.05□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 COX12YLR038C 252 nt0.05□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.03□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YER079WYER079W 633 nt0.03□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 YKL063CYKL063C 504 nt0.03□□□□□ -2.4
MRPL28P36527 NIP1YMR309C 2439 nt0.03□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YCR022CYCR022C 345 nt0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 SSS1YDR086C 243 nt0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 ULI1YFR026C 510 nt0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YPR092WYPR092W 306 nt0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 RPL35AYDL191W 363 nt0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 QCR9YGR183C 201 nt0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 PRM3YPL192C 402 nt0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YPL205CYPL205C 345 nt0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 COY1YKL179C 2040 nt0□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YLR282CYLR282C 342 nt0□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 BUL2YML111W 2763 nt-0□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 COG8YML071C 1824 nt-0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YLR202CYLR202C 327 nt-0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 HTB2YBL002W 396 nt-0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YBR285WYBR285W 435 nt-0.01□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 STE5YDR103W 2754 nt-0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YKL136WYKL136W 399 nt-0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.02□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 AGA2YGL032C 264 nt-0.03□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YOR121CYOR121C 306 nt-0.03□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.03□□□□□ -2.41
MRPL28P36527 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.04□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.04□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.04□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YAR053WYAR053W 297 nt-0.05□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 SOV1YMR066W 2697 nt-0.05□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YKU70YMR284W 1809 nt-0.06□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.06□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.06□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.07□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.07□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 RPS27BYHR021C 249 nt-0.08□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YJR157WYJR157W 363 nt-0.08□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YNL324WYNL324W 396 nt-0.09□□□□□ -2.42
MRPL28P36527 YDR048CYDR048C 315 nt-0.1□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YEL073CYEL073C 324 nt-0.1□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YLR041WYLR041W 321 nt-0.1□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.11□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.12□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 snR45snR45 172 nt-0.12□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 THO2YNL139C 4794 nt-0.12□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 SNU13YEL026W 381 nt-0.14□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 BLI1YKL061W 342 nt-0.14□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.14□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YFL063WYFL063W 456 nt-0.15□□□□□ -2.43
MRPL28P36527 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.16□□□□□ -2.44
MRPL28P36527 YLR232WYLR232W 348 nt-0.16□□□□□ -2.44
MRPL28P36527 CSE2YNR010W 450 nt-0.16□□□□□ -2.44
MRPL28P36527 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.16□□□□□ -2.44
MRPL28P36527 Q0017Q0017 162 nt-0.16□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.7 ms