Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFLP07196 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFLP07196 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms