Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 YIL032CYIL032C 357 nt1.41□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YCK3YER123W 1575 nt1.41□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 SBE22YHR103W 2559 nt1.41□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YHL042WYHL042W 453 nt1.4□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 SAC3YDR159W 3906 nt1.39□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 FIG4YNL325C 2640 nt1.39□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 YLR419WYLR419W 4308 nt1.38□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 FYV8YGR196C 2454 nt1.38□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 snR60snR60 104 nt1.38□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 ALG13YGL047W 609 nt1.38□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 snR14snR14 160 nt1.38□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 IFH1YLR223C 3258 nt1.38□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 ALY2YJL084C 3141 nt1.37□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 ANS1YHR126C 480 nt1.37□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 YDL206WYDL206W 2289 nt1.37□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 YCS4YLR272C 3531 nt1.36□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 SWI4YER111C 3282 nt1.36□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.36□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 SMC1YFL008W 3678 nt1.36□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 SEC3YER008C 4011 nt1.36□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 SSS1YDR086C 243 nt1.35□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 CDC31YOR257W 486 nt1.35□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 NUP145YGL092W 3954 nt1.34□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 snR65snR65 100 nt1.34□□□□□ -2.19
SPE4Q12455 MSN5YDR335W 3675 nt1.34□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 PIK1YNL267W 3201 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 APL3YBL037W 3078 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YLL020CYLL020C 306 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YMR321CYMR321C 318 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 PDE2YOR360C 1581 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 SPC110YDR356W 2835 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 CDC25YLR310C 4770 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 AHC1YOR023C 1701 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 LAA1YJL207C 6045 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 SEC21YNL287W 2808 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 RPS25BYLR333C 327 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 CSE2YNR010W 450 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 VIK1YPL253C 1944 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 CLU1YMR012W 3834 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 STO1YMR125W 2586 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 PAN2YGL094C 3348 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YDR521WYDR521W 336 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YOR218CYOR218C 420 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 NUP188YML103C 4968 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 SET3YKR029C 2256 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YDR344CYDR344C 444 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 COG8YML071C 1824 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 POL5YEL055C 3069 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 CDC36YDL165W 576 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 RPS27BYHR021C 249 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YNL028WYNL028W 318 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 YAR009CYAR009C 3591 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 RRT15YLR162W-A 189 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 SLD3YGL113W 2007 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE4Q12455 WAR1YML076C 2835 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 HKR1YDR420W 5409 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YJL120WYJL120W 324 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 RSM22YKL155C 1887 nt1.26□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.26□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 RPL33BYOR234C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 SPO75YLL005C 2607 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 RAD61YDR014W 1944 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 SPO21YOL091W 1830 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YBR206WYBR206W 324 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YER181CYER181C 324 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YGR069WYGR069W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 INA22YIR024C 651 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.23□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.23□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 ROM2YLR371W 4071 nt1.23□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 EAF1YDR359C 2949 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE4Q12455 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.21□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 MCM10YIL150C 1716 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 ECM12YHR021W-A 456 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 IES4YOR189W 351 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 RAD9YDR217C 3930 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 IML1YJR138W 4755 nt1.19□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 YGR130CYGR130C 2451 nt1.19□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 TRM732YMR259C 4263 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 OLI1Q0130 231 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 YBR064WYBR064W 429 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 STB6YKL072W 2301 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 GEA2YEL022W 4380 nt1.17□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 NUP157YER105C 4176 nt1.16□□□□□ -2.22
SPE4Q12455 PAA1YDR071C 576 nt1.15□□□□□ -2.23
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