Protein–RNA interactions for Protein: Q12445

POM34, Nucleoporin POM34, yeastyeast

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34Q12445 ALK1YGL021W 2283 nt1.86□□□□□ -2.11
POM34Q12445 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.86□□□□□ -2.11
POM34Q12445 TFC3YAL001C 3483 nt1.86□□□□□ -2.11
POM34Q12445 ATG9YDL149W 2994 nt1.86□□□□□ -2.11
POM34Q12445 SFB2YNL049C 2631 nt1.86□□□□□ -2.11
POM34Q12445 AHC1YOR023C 1701 nt1.86□□□□□ -2.11
POM34Q12445 BPH1YCR032W 6504 nt1.85□□□□□ -2.11
POM34Q12445 YDR521WYDR521W 336 nt1.85□□□□□ -2.11
POM34Q12445 YOR345CYOR345C 351 nt1.85□□□□□ -2.11
POM34Q12445 snR52snR52 92 nt1.85□□□□□ -2.11
POM34Q12445 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
POM34Q12445 PIP2YOR363C 2991 nt1.85□□□□□ -2.11
POM34Q12445 PDR8YLR266C 2106 nt1.84□□□□□ -2.11
POM34Q12445 TDA9YML081W 3756 nt1.84□□□□□ -2.11
POM34Q12445 LRE1YCL051W 1752 nt1.84□□□□□ -2.12
POM34Q12445 SLI15YBR156C 2097 nt1.84□□□□□ -2.12
POM34Q12445 COG4YPR105C 2586 nt1.84□□□□□ -2.12
POM34Q12445 UTP21YLR409C 2820 nt1.84□□□□□ -2.12
POM34Q12445 SAP190YKR028W 3102 nt1.84□□□□□ -2.12
POM34Q12445 PKH2YOL100W 3246 nt1.83□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YDL196WYDL196W 330 nt1.83□□□□□ -2.12
POM34Q12445 PBY1YBR094W 2262 nt1.83□□□□□ -2.12
POM34Q12445 SEC16YPL085W 6588 nt1.82□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.82□□□□□ -2.12
POM34Q12445 snR70snR70 164 nt1.82□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YBR206WYBR206W 324 nt1.82□□□□□ -2.12
POM34Q12445 AIM44YPL158C 2277 nt1.82□□□□□ -2.12
POM34Q12445 NCA2YPR155C 1851 nt1.82□□□□□ -2.12
POM34Q12445 SPO24YPR036W-A 204 nt1.81□□□□□ -2.12
POM34Q12445 FIG4YNL325C 2640 nt1.81□□□□□ -2.12
POM34Q12445 DNA2YHR164C 4569 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 NEO1YIL048W 3456 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 SPP41YDR464W 4308 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 APL5YPL195W 2799 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YHR210CYHR210C 1026 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 IFH1YLR223C 3258 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 MGA2YIR033W 3342 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 GCN2YDR283C 4980 nt1.8□□□□□ -2.12
POM34Q12445 SLD3YGL113W 2007 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YJR039WYJR039W 3366 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 RPL33BYOR234C 324 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 NUP170YBL079W 4509 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 YLR419WYLR419W 4308 nt1.79□□□□□ -2.12
POM34Q12445 DGR1YNL130C-A 147 nt1.78□□□□□ -2.12
POM34Q12445 PDR3YBL005W 2931 nt1.78□□□□□ -2.12
POM34Q12445 ATP8Q0080 147 nt1.77□□□□□ -2.13
POM34Q12445 NUT1YGL151W 3399 nt1.76□□□□□ -2.13
POM34Q12445 EMC5YIL027C 426 nt1.76□□□□□ -2.13
POM34Q12445 LHS1YKL073W 2646 nt1.76□□□□□ -2.13
POM34Q12445 RAD50YNL250W 3939 nt1.75□□□□□ -2.13
POM34Q12445 ADR1YDR216W 3972 nt1.75□□□□□ -2.13
POM34Q12445 SBE22YHR103W 2559 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 PMP1YCR024C-A 123 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 BRE1YDL074C 2103 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 TMA7YLR262C-A 195 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 COY1YKL179C 2040 nt1.74□□□□□ -2.13
POM34Q12445 YEL073CYEL073C 324 nt1.73□□□□□ -2.13
POM34Q12445 UBP2YOR124C 3819 nt1.73□□□□□ -2.13
POM34Q12445 MDS3YGL197W 4464 nt1.73□□□□□ -2.13
POM34Q12445 UFD4YKL010C 4452 nt1.73□□□□□ -2.13
POM34Q12445 TBS1YBR150C 3285 nt1.72□□□□□ -2.13
POM34Q12445 HAL9YOL089C 3093 nt1.72□□□□□ -2.13
POM34Q12445 YOR170WYOR170W 306 nt1.72□□□□□ -2.13
POM34Q12445 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.72□□□□□ -2.13
POM34Q12445 YDL206WYDL206W 2289 nt1.71□□□□□ -2.13
POM34Q12445 UTP22YGR090W 3714 nt1.71□□□□□ -2.13
POM34Q12445 SLN1YIL147C 3663 nt1.71□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.71□□□□□ -2.14
POM34Q12445 SKI3YPR189W 4299 nt1.71□□□□□ -2.14
POM34Q12445 UFD2YDL190C 2886 nt1.7□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.7□□□□□ -2.14
POM34Q12445 INO80YGL150C 4470 nt1.7□□□□□ -2.14
POM34Q12445 MON2YNL297C 4911 nt1.7□□□□□ -2.14
POM34Q12445 SMC4YLR086W 4257 nt1.69□□□□□ -2.14
POM34Q12445 TRM3YDL112W 4311 nt1.69□□□□□ -2.14
POM34Q12445 ALY2YJL084C 3141 nt1.69□□□□□ -2.14
POM34Q12445 SLX4YLR135W 2247 nt1.68□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.68□□□□□ -2.14
POM34Q12445 KIP1YBL063W 3336 nt1.68□□□□□ -2.14
POM34Q12445 FKS1YLR342W 5631 nt1.68□□□□□ -2.14
POM34Q12445 KCS1YDR017C 3153 nt1.67□□□□□ -2.14
POM34Q12445 IRC20YLR247C 4671 nt1.67□□□□□ -2.14
POM34Q12445 CTF4YPR135W 2784 nt1.67□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.67□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YJL022WYJL022W 309 nt1.67□□□□□ -2.14
POM34Q12445 RPS30BYOR182C 192 nt1.67□□□□□ -2.14
POM34Q12445 PAA1YDR071C 576 nt1.66□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YNL170WYNL170W 396 nt1.66□□□□□ -2.14
POM34Q12445 snR14snR14 160 nt1.66□□□□□ -2.14
POM34Q12445 YPP1YGR198W 2454 nt1.66□□□□□ -2.14
POM34Q12445 MMS4YBR098W 2076 nt1.65□□□□□ -2.14
POM34Q12445 APL1YJR005W 2103 nt1.65□□□□□ -2.15
POM34Q12445 SEC31YDL195W 3822 nt1.64□□□□□ -2.15
POM34Q12445 COX12YLR038C 252 nt1.64□□□□□ -2.15
POM34Q12445 PAN2YGL094C 3348 nt1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.7 ms