Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YBR174CYBR174C 315 nt2.17□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 PBY1YBR094W 2262 nt2.17□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 PKH2YOL100W 3246 nt2.17□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 USO1YDL058W 5373 nt2.16□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.16□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 GCN2YDR283C 4980 nt2.15□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 EMC5YIL027C 426 nt2.15□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 PAM16YJL104W 450 nt2.15□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YOR302WYOR302W 78 nt2.15□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 SGF11YPL047W 300 nt2.15□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YKU70YMR284W 1809 nt2.14□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.14□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 SPO24YPR036W-A 204 nt2.14□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 COG4YPR105C 2586 nt2.14□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.13□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.13□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 ALK1YGL021W 2283 nt2.12□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 ADR1YDR216W 3972 nt2.12□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.12□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 OLI1Q0130 231 nt2.12□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 snR74snR74 88 nt2.11□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 ISD11YER048W-A 285 nt2.11□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 SKI3YPR189W 4299 nt2.11□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 RAD50YNL250W 3939 nt2.1□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YDR521WYDR521W 336 nt2.1□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YOR376WYOR376W 369 nt2.1□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 NUT1YGL151W 3399 nt2.1□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 PIP2YOR363C 2991 nt2.1□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 TRM3YDL112W 4311 nt2.09□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 IFH1YLR223C 3258 nt2.09□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YEL014CYEL014C 306 nt2.09□□□□□ -2.07
SSF2Q12153 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.09□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 KIP1YBL063W 3336 nt2.09□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 CTF4YPR135W 2784 nt2.09□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 PKH3YDR466W 2697 nt2.08□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 Q0032Q0032 291 nt2.08□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 ECM12YHR021W-A 456 nt2.08□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 UFD2YDL190C 2886 nt2.08□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 YLL054CYLL054C 2532 nt2.07□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 AIM44YPL158C 2277 nt2.06□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.05□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 SLD3YGL113W 2007 nt2.04□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 YHR210CYHR210C 1026 nt2.04□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 YOR225WYOR225W 330 nt2.04□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 TBS1YBR150C 3285 nt2.04□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 SBE22YHR103W 2559 nt2.04□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 SLX4YLR135W 2247 nt2.03□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 COF1YLL050C 432 nt2.03□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 YBR206WYBR206W 324 nt2.03□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 MMS4YBR098W 2076 nt2.03□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 CFT1YDR301W 4074 nt2.03□□□□□ -2.08
SSF2Q12153 ULI1YFR026C 510 nt2.02□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 NCA2YPR155C 1851 nt2.02□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 MYO2YOR326W 4725 nt2.02□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 AHC1YOR023C 1701 nt2.02□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 RTP1YMR185W 2946 nt2.01□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 ALY2YJL084C 3141 nt2.01□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YGL217CYGL217C 342 nt2.01□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YJL022WYJL022W 309 nt2.01□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.01□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 KCS1YDR017C 3153 nt2□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YCS4YLR272C 3531 nt1.99□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.99□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YDL206WYDL206W 2289 nt1.99□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 PAN2YGL094C 3348 nt1.99□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 SMC4YLR086W 4257 nt1.98□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YLR140WYLR140W 327 nt1.98□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YNL198CYNL198C 303 nt1.98□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 LRE1YCL051W 1752 nt1.98□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YJL182CYJL182C 318 nt1.97□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 YOR019WYOR019W 2193 nt1.97□□□□□ -2.09
SSF2Q12153 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.96□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YOR093CYOR093C 4947 nt1.96□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 FIG4YNL325C 2640 nt1.96□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 MEC1YBR136W 7107 nt1.95□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.95□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.95□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YDL196WYDL196W 330 nt1.94□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.94□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YMR045CYMR045C 5268 nt1.94□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YLR422WYLR422W 5799 nt1.93□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 BST1YFL025C 3090 nt1.92□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 BRR2YER172C 6492 nt1.92□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 SMC1YFL008W 3678 nt1.92□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 NUP192YJL039C 5052 nt1.91□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.91□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.91□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 DNF3YMR162C 4971 nt1.91□□□□□ -2.1
SSF2Q12153 YGR151CYGR151C 336 nt1.9□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.9□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 COA6YMR244C-A 315 nt1.9□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 APL1YJR005W 2103 nt1.9□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.89□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 snR14snR14 160 nt1.89□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 KAP122YGL016W 3246 nt1.89□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 YAR009CYAR009C 3591 nt1.88□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 IRC20YLR247C 4671 nt1.87□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 YOR345CYOR345C 351 nt1.87□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 MON2YNL297C 4911 nt1.87□□□□□ -2.11
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