Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YLL007CYLL007C 1998 nt1.36□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 SSK2YNR031C 4740 nt1.36□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 DBP6YNR038W 1890 nt1.36□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 SEC21YNL287W 2808 nt1.36□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 FYV8YGR196C 2454 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YCK3YER123W 1575 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YER097WYER097W 330 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 LAA1YJL207C 6045 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 ALY2YJL084C 3141 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 PBY1YBR094W 2262 nt1.35□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 IFH1YLR223C 3258 nt1.34□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 TRM732YMR259C 4263 nt1.34□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 SLD3YGL113W 2007 nt1.34□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YPR063CYPR063C 423 nt1.34□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 MSN5YDR335W 3675 nt1.34□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 SET3YKR029C 2256 nt1.33□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 STO1YMR125W 2586 nt1.33□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 APL3YBL037W 3078 nt1.33□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 HTL1YCR020W-B 237 nt1.33□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YGL149WYGL149W 306 nt1.32□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 RRT15YLR162W-A 189 nt1.32□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 NUP145YGL092W 3954 nt1.32□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 MDS3YGL197W 4464 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 PDE2YOR360C 1581 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 HMRA2YCR096C 360 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 SSS1YDR086C 243 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YFL063WYFL063W 456 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 ANS1YHR126C 480 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 RPL39YJL189W 156 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.31□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YCS4YLR272C 3531 nt1.3□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 SEC3YER008C 4011 nt1.3□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 RSM22YKL155C 1887 nt1.29□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YDR521WYDR521W 336 nt1.29□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YIL032CYIL032C 357 nt1.29□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.29□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YAR009CYAR009C 3591 nt1.29□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 STE5YDR103W 2754 nt1.28□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 snR60snR60 104 nt1.28□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.28□□□□□ -2.2
NMD4Q12129 SMC1YFL008W 3678 nt1.28□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 WAR1YML076C 2835 nt1.27□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YLR422WYLR422W 5799 nt1.27□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 RPS25BYLR333C 327 nt1.26□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YBR206WYBR206W 324 nt1.26□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 EAF1YDR359C 2949 nt1.26□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 PAN2YGL094C 3348 nt1.26□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 AHC1YOR023C 1701 nt1.26□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 CDC25YLR310C 4770 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YDR344CYDR344C 444 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.25□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 STB6YKL072W 2301 nt1.24□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YHL042WYHL042W 453 nt1.24□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 ALG13YGL047W 609 nt1.23□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YJL120WYJL120W 324 nt1.23□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.23□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 CDC39YCR093W 6327 nt1.23□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 VIK1YPL253C 1944 nt1.23□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 SPO75YLL005C 2607 nt1.22□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 GEA2YEL022W 4380 nt1.22□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 YMR321CYMR321C 318 nt1.22□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 SPO21YOL091W 1830 nt1.22□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 RAD9YDR217C 3930 nt1.21□□□□□ -2.21
NMD4Q12129 INA22YIR024C 651 nt1.21□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.21□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 ECM12YHR021W-A 456 nt1.2□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.2□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YNL146WYNL146W 303 nt1.2□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YBR064WYBR064W 429 nt1.2□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 COG8YML071C 1824 nt1.19□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 CDC36YDL165W 576 nt1.19□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 RPS27BYHR021C 249 nt1.19□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YOR218CYOR218C 420 nt1.19□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 NST1YNL091W 3723 nt1.19□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 RPL33BYOR234C 324 nt1.17□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 NUP157YER105C 4176 nt1.17□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 IML1YJR138W 4755 nt1.17□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 OLI1Q0130 231 nt1.16□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 CSE2YNR010W 450 nt1.16□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 ROM2YLR371W 4071 nt1.16□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 CLU1YMR012W 3834 nt1.16□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YGR130CYGR130C 2451 nt1.15□□□□□ -2.22
NMD4Q12129 YNL028WYNL028W 318 nt1.15□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 RAD61YDR014W 1944 nt1.13□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 snR65snR65 100 nt1.13□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 SGF11YPL047W 300 nt1.13□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.12□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.12□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 MCM10YIL150C 1716 nt1.11□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 SIP4YJL089W 2490 nt1.1□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 SPT7YBR081C 3999 nt1.1□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 YGR069WYGR069W 336 nt1.1□□□□□ -2.23
NMD4Q12129 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31 ms