Protein–RNA interactions for Protein: Q12015

YOR223W, Transmembrane protein YOR223W, yeastyeast

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR223WQ12015 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
YOR223WQ12015 IRA2YOL081W 9240 nt2.47□□□□□ -2.01
YOR223WQ12015 SKP2YNL311C 2292 nt2.46□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YEF3YLR249W 3135 nt2.46□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 DCP2YNL118C 2913 nt2.45□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 VPS8YAL002W 3825 nt2.45□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 ISW1YBR245C 3390 nt2.44□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YDR521WYDR521W 336 nt2.44□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 NUM1YDR150W 8247 nt2.44□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 BUB1YGR188C 3066 nt2.43□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YNL018CYNL018C 1839 nt2.43□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YDL118WYDL118W 381 nt2.43□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.43□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 CSF1YLR087C 8877 nt2.43□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 SLN1YIL147C 3663 nt2.43□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YOR019WYOR019W 2193 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 SMC6YLR383W 3345 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 TFC3YAL001C 3483 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 MET18YIL128W 3099 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 ALK1YGL021W 2283 nt2.42□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 TOP2YNL088W 4287 nt2.41□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 PRP5YBR237W 2550 nt2.41□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 SAP185YJL098W 3177 nt2.41□□□□□ -2.02
YOR223WQ12015 MAK10YEL053C 2202 nt2.4□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 SOM1YEL059C-A 225 nt2.4□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.4□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 SGM1YJR134C 2124 nt2.4□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 UBR1YGR184C 5853 nt2.4□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 MSH5YDL154W 2706 nt2.4□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 SAP190YKR028W 3102 nt2.39□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 SCD5YOR329C 2619 nt2.39□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.39□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 MLH3YPL164C 2148 nt2.39□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 DNA2YHR164C 4569 nt2.38□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 NEW1YPL226W 3591 nt2.38□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 TTI1YKL033W 3117 nt2.37□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 PSD2YGR170W 3417 nt2.37□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.37□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 DGR1YNL130C-A 147 nt2.37□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 YLL054CYLL054C 2532 nt2.36□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 CHS6YJL099W 2241 nt2.36□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 FAR11YNL127W 2862 nt2.36□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 UFD4YKL010C 4452 nt2.36□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 HMI1YOL095C 2121 nt2.36□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 UBP2YOR124C 3819 nt2.36□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 FKS3YMR306W 5358 nt2.35□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 RPS29AYLR388W 171 nt2.34□□□□□ -2.03
YOR223WQ12015 TRS130YMR218C 3309 nt2.34□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 STF2YGR008C 255 nt2.33□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 PKH2YOL100W 3246 nt2.32□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 INO80YGL150C 4470 nt2.31□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 KRE33YNL132W 3171 nt2.31□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 NUP100YKL068W 2880 nt2.31□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 APL1YJR005W 2103 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 MDS3YGL197W 4464 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 YGL182CYGL182C 324 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 AGC1YPR021C 2709 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 CHC1YGL206C 4962 nt2.3□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 SPP41YDR464W 4308 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 PDR11YIL013C 4236 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 SEC31YDL195W 3822 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 COG4YPR105C 2586 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 snR70snR70 164 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 UBP1YDL122W 2430 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 SSD1YDR293C 3753 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 YNL144CYNL144C 2223 nt2.29□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 PDR3YBL005W 2931 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 LHS1YKL073W 2646 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 BUD2YKL092C 3315 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 STB6YKL072W 2301 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 TUS1YLR425W 3924 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.28□□□□□ -2.04
YOR223WQ12015 TOF1YNL273W 3717 nt2.27□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.26□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 GIP3YPL137C 3831 nt2.26□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 SCP160YJL080C 3669 nt2.26□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 SLI15YBR156C 2097 nt2.26□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 TRL1YJL087C 2484 nt2.25□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.25□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 RCO1YMR075W 2055 nt2.25□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 SYH1YPL105C 2550 nt2.25□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 HSL1YKL101W 4557 nt2.25□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 STH1YIL126W 4080 nt2.24□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 CTR9YOL145C 3234 nt2.24□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 QCR9YGR183C 201 nt2.24□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 RAV1YJR033C 4074 nt2.23□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.23□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 NAB6YML117W 3405 nt2.23□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 YDL206WYDL206W 2289 nt2.22□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.22□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 snR39BsnR39B 96 nt2.22□□□□□ -2.05
YOR223WQ12015 BFR2YDR299W 1605 nt2.21□□□□□ -2.06
YOR223WQ12015 CDC60YPL160W 3273 nt2.21□□□□□ -2.06
YOR223WQ12015 RPL37BYDR500C 267 nt2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.8 ms