Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 CSN9YDR179C 489 nt0.83□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YDR426CYDR426C 378 nt0.83□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 BIL1YOR304C-A 231 nt0.83□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 EAF1YDR359C 2949 nt0.83□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 SET3YKR029C 2256 nt0.82□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 STB6YKL072W 2301 nt0.82□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 MDS3YGL197W 4464 nt0.82□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 CDC39YCR093W 6327 nt0.82□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 RPL34BYIL052C 366 nt0.81□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 MAM33YIL070C 801 nt0.81□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.81□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.81□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YAR009CYAR009C 3591 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 PDE2YOR360C 1581 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 UBP3YER151C 2739 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 GPG1YGL121C 381 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 NST1YNL091W 3723 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 FIG4YNL325C 2640 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 CUL3YGR003W 2235 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 VAM6YDL077C 3150 nt0.8□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 NUP157YER105C 4176 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 SLD3YGL113W 2007 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YDL206WYDL206W 2289 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 HMRA1YCR097W 381 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 RPL35AYDL191W 363 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 STO1YMR125W 2586 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 PKH2YOL100W 3246 nt0.79□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 CDC36YDL165W 576 nt0.78□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.78□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YJR011CYJR011C 786 nt0.78□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.78□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.78□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 YHL042WYHL042W 453 nt0.77□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt0.77□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 HTB2YBL002W 396 nt0.77□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 OST1YJL002C 1431 nt0.77□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YLL007CYLL007C 1998 nt0.77□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 PTP2YOR208W 2253 nt0.77□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 BEM2YER155C 6504 nt0.76□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YDR521WYDR521W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YAR029WYAR029W 225 nt0.76□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 TAR1YLR154W-C 375 nt0.76□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.76□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YPR197CYPR197C 564 nt0.76□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 RAD9YDR217C 3930 nt0.75□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 snR56snR56 88 nt0.74□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 KAP120YPL125W 3099 nt0.74□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 DOP1YDR141C 5097 nt0.74□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YAF9YNL107W 681 nt0.73□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.73□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YCK3YER123W 1575 nt0.73□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 BUD3YCL014W 4911 nt0.73□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 WAR1YML076C 2835 nt0.73□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 HMRA2YCR096C 360 nt0.72□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YDR102CYDR102C 333 nt0.72□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 GIM4YEL003W 336 nt0.72□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.72□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 PAM16YJL104W 450 nt0.72□□□□□ -2.29
RDS3Q06835 RPS30BYOR182C 192 nt0.71□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YBR206WYBR206W 324 nt0.71□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.7□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YDR048CYDR048C 315 nt0.7□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YJL120WYJL120W 324 nt0.7□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 RPS25BYLR333C 327 nt0.69□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 HTL1YCR020W-B 237 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 PAU12YGR294W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 PRP16YKR086W 3216 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YBR064WYBR064W 429 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 PAU24YBR301W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 ISD11YER048W-A 285 nt0.67□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 INA22YIR024C 651 nt0.67□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YDL073WYDL073W 2955 nt0.67□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 APL1YJR005W 2103 nt0.67□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 SSS1YDR086C 243 nt0.66□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 ATP6Q0085 780 nt0.66□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YMR321CYMR321C 318 nt0.66□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 SPO21YOL091W 1830 nt0.66□□□□□ -2.3
RDS3Q06835 YDL196WYDL196W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 OLI1Q0130 231 nt0.65□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.65□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 SCC2YDR180W 4482 nt0.65□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YPL044CYPL044C 549 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YPL225WYPL225W 441 nt0.64□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 DBP6YNR038W 1890 nt0.63□□□□□ -2.31
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