Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC63Q05C16 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms