Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms