Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	SDH2	YLL041C	801 nt		1.03	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	ROM2	YLR371W	4071 nt		1.03	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	NUT1	YGL151W	3399 nt		1.03	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	RFX1	YLR176C	2436 nt		1.03	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YLL032C	YLL032C	2478 nt		1.03	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	RPL34B	YIL052C	366 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	INA22	YIR024C	651 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YLL020C	YLL020C	306 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	SPT21	YMR179W	2277 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	RPB10	YOR210W	213 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YPR117W	YPR117W	7470 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	ENV11	YGR071C	2583 nt		1.02	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	EFR3	YMR212C	2349 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	MPT5	YGL178W	2580 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YDR426C	YDR426C	378 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YKL118W	YKL118W	312 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	snR14	snR14	160 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		1.01	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		1	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YAR029W	YAR029W	225 nt		1	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YOR199W	YOR199W	330 nt		1	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	NUP188	YML103C	4968 nt		1	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	VAM6	YDL077C	3150 nt		1	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YKL136W	YKL136W	399 nt		0.99	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	HTB2	YBL002W	396 nt		0.99	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YMR175W-A	YMR175W-A	195 nt		0.99	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		0.99	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	UTP20	YBL004W	7482 nt		0.98	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	SCW11	YGL028C	1629 nt		0.98	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	SSS1	YDR086C	243 nt		0.98	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		0.98	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		0.98	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	NST1	YNL091W	3723 nt		0.98	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	DBP6	YNR038W	1890 nt		0.97	□□□□□ -2.25
ATG12	P38316	SCC2	YDR180W	4482 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	PAU12	YGR294W	363 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	INP2	YMR163C	2118 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YNL146W	YNL146W	303 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	PAU24	YBR301W	363 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	NUP157	YER105C	4176 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	OST1	YJL002C	1431 nt		0.96	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	NPC2	YDL046W	522 nt		0.95	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YDR344C	YDR344C	444 nt		0.95	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		0.95	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	TAR1	YLR154W-C	375 nt		0.95	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	APL1	YJR005W	2103 nt		0.95	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	APL3	YBL037W	3078 nt		0.94	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YFL063W	YFL063W	456 nt		0.94	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	RPL38	YLR325C	237 nt		0.94	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YOR108C-A	YOR108C-A	210 nt		0.94	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	SLD3	YGL113W	2007 nt		0.94	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	MMS4	YBR098W	2076 nt		0.93	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	NIP100	YPL174C	2607 nt		0.93	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YIL142C-A	YIL142C-A	333 nt		0.93	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	DOP1	YDR141C	5097 nt		0.93	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	EAF1	YDR359C	2949 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	STE5	YDR103W	2754 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	snR60	snR60	104 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	MAM33	YIL070C	801 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	PCC1	YKR095W-A	267 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YMR031W-A	YMR031W-A	327 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YOL160W	YOL160W	342 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YBR200W-A	YBR200W-A	165 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	ZIP2	YGL249W	2115 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	RIM20	YOR275C	1986 nt		0.92	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		0.91	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	SLI15	YBR156C	2097 nt		0.91	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	ALY2	YJL084C	3141 nt		0.91	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	LCD1	YDR499W	2244 nt		0.91	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	FIG4	YNL325C	2640 nt		0.9	□□□□□ -2.26
ATG12	P38316	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YIL032C	YIL032C	357 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YOR015W	YOR015W	360 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	PDE2	YOR360C	1581 nt		0.9	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	STB6	YKL072W	2301 nt		0.89	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	RAD34	YDR314C	2079 nt		0.89	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YCK3	YER123W	1575 nt		0.89	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	QCR9	YGR183C	201 nt		0.89	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YBR221W-A	YBR221W-A	105 nt		0.89	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	SET3	YKR029C	2256 nt		0.89	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	ALG13	YGL047W	609 nt		0.88	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YGR069W	YGR069W	336 nt		0.88	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		0.88	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	CDC39	YCR093W	6327 nt		0.88	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	STO1	YMR125W	2586 nt		0.87	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	HTL1	YCR020W-B	237 nt		0.87	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	EMT1	tM(CAU)D	73 nt		0.87	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	YGL149W	YGL149W	306 nt		0.87	□□□□□ -2.27
ATG12	P38316	EMT5	tM(CAU)J1	73 nt		0.87	□□□□□ -2.27

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