Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHAC2Q9Y5I4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms