Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms