Protein–RNA interactions for Protein: Q12513

TMA17, Translation machinery-associated protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA17Q12513 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.9□□□□□ -2.1
TMA17Q12513 DBP6YNR038W 1890 nt1.9□□□□□ -2.1
TMA17Q12513 SCD5YOR329C 2619 nt1.9□□□□□ -2.1
TMA17Q12513 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.9□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 UBP2YOR124C 3819 nt1.9□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 UFD2YDL190C 2886 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 RPL31AYDL075W 342 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YHL042WYHL042W 453 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 SPO24YPR036W-A 204 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 DNF3YMR162C 4971 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 SEC5YDR166C 2916 nt1.88□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.88□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 SPC98YNL126W 2541 nt1.88□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 TRM3YDL112W 4311 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YER181CYER181C 324 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YIL032CYIL032C 357 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YOR019WYOR019W 2193 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 CUL3YGR003W 2235 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 NEO1YIL048W 3456 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 KIP1YBL063W 3336 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 NCA2YPR155C 1851 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 LCD1YDR499W 2244 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 SLI15YBR156C 2097 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 VPS54YDR027C 2670 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 ALG13YGL047W 609 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 COF1YLL050C 432 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YOR376WYOR376W 369 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YMR045CYMR045C 5268 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 RAD50YNL250W 3939 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YLL054CYLL054C 2532 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 CLU1YMR012W 3834 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 SCW11YGL028C 1629 nt1.84□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.84□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 DGR1YNL130C-A 147 nt1.84□□□□□ -2.11
TMA17Q12513 FKS1YLR342W 5631 nt1.84□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 PTP2YOR208W 2253 nt1.84□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 MSB1YOR188W 3414 nt1.84□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 BST1YFL025C 3090 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 SPT21YMR179W 2277 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YDR344CYDR344C 444 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 RPL34BYIL052C 366 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YJL022WYJL022W 309 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 HMRA2YCR096C 360 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 VPS55YJR044C 423 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 ALY2YJL084C 3141 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 KAP122YGL016W 3246 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 COG8YML071C 1824 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 TFC3YAL001C 3483 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 ALK1YGL021W 2283 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YCK3YER123W 1575 nt1.81□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 ATP7YKL016C 525 nt1.81□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YGL217CYGL217C 342 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YLR140WYLR140W 327 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 AIM44YPL158C 2277 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 COG4YPR105C 2586 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 SSS1YDR086C 243 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 SLX4YLR135W 2247 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 IFH1YLR223C 3258 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 UFD4YKL010C 4452 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 snR60snR60 104 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 MPT5YGL178W 2580 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA17Q12513 YLL007CYLL007C 1998 nt1.78□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 YLR422WYLR422W 5799 nt1.78□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.77□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 YMR321CYMR321C 318 nt1.77□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.77□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 PKH2YOL100W 3246 nt1.77□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 SMC4YLR086W 4257 nt1.76□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 MMS4YBR098W 2076 nt1.75□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 GPG1YGL121C 381 nt1.75□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 ROM2YLR371W 4071 nt1.74□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 VIK1YPL253C 1944 nt1.74□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 BRE1YDL074C 2103 nt1.74□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 YNL028WYNL028W 318 nt1.74□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 PAN2YGL094C 3348 nt1.74□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 MON2YNL297C 4911 nt1.73□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 PBY1YBR094W 2262 nt1.73□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 YHR210CYHR210C 1026 nt1.73□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 SPO75YLL005C 2607 nt1.73□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 FAB1YFR019W 6837 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 EST2YLR318W 2655 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 RAD61YDR014W 1944 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 SXM1YDR395W 2835 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA17Q12513 MSN5YDR335W 3675 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 RPS25BYLR333C 327 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 CSE2YNR010W 450 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YOR218CYOR218C 420 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97.7 ms