Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 SEY1YOR165W 2331 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 TDA9YML081W 3756 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 MSH5YDL154W 2706 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 KOG1YHR186C 4674 nt2.43□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 AGC1YPR021C 2709 nt2.42□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.42□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 NIP100YPL174C 2607 nt2.42□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 GYP5YPL249C 2685 nt2.41□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.41□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.41□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 RLM1YPL089C 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 SEC63YOR254C 1992 nt2.4□□□□□ -2.02
SSF2Q12153 snR80snR80 171 nt2.4□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.4□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 HSH155YMR288W 2916 nt2.4□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 REV3YPL167C 4515 nt2.4□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 DGR2YKL121W 2559 nt2.39□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 DGR1YNL130C-A 147 nt2.39□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YCK3YER123W 1575 nt2.39□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 ATG9YDL149W 2994 nt2.38□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YDL118WYDL118W 381 nt2.38□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.38□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.37□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YGL052WYGL052W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 APL2YKL135C 2181 nt2.37□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 FAB1YFR019W 6837 nt2.37□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.36□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YGL041CYGL041C 204 nt2.36□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 INA22YIR024C 651 nt2.36□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.36□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YCL023CYCL023C 348 nt2.36□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 STH1YIL126W 4080 nt2.36□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 MAD1YGL086W 2250 nt2.35□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 RAD34YDR314C 2079 nt2.35□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 GPG1YGL121C 381 nt2.35□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.35□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 PDE2YOR360C 1581 nt2.35□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 SPC98YNL126W 2541 nt2.34□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 MGA2YIR033W 3342 nt2.34□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 ENV11YGR071C 2583 nt2.34□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 PDR8YLR266C 2106 nt2.34□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YNL337WYNL337W 255 nt2.34□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 MYO4YAL029C 4416 nt2.34□□□□□ -2.03
SSF2Q12153 YMR321CYMR321C 318 nt2.33□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 ELG1YOR144C 2376 nt2.33□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 PIG1YLR273C 1947 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 MPT5YGL178W 2580 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 VPS54YDR027C 2670 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 FKS1YLR342W 5631 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 RPL34BYIL052C 366 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 YIR044CYIR044C 186 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 YOR218CYOR218C 420 nt2.32□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 PAU2YEL049W 363 nt2.31□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 RPS27BYHR021C 249 nt2.31□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 MSH6YDR097C 3729 nt2.31□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.3□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 TMA7YLR262C-A 195 nt2.3□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 IES4YOR189W 351 nt2.3□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 SEC31YDL195W 3822 nt2.3□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 CUL3YGR003W 2235 nt2.29□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 HSL1YKL101W 4557 nt2.29□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 PTP2YOR208W 2253 nt2.28□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 HIR3YJR140C 4947 nt2.28□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 SFB2YNL049C 2631 nt2.28□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 TOR2YKL203C 7425 nt2.28□□□□□ -2.04
SSF2Q12153 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.27□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 NEO1YIL048W 3456 nt2.27□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 UTP21YLR409C 2820 nt2.27□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YOR015WYOR015W 360 nt2.27□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YNL144CYNL144C 2223 nt2.27□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 CSF1YLR087C 8877 nt2.26□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.26□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 NOC3YLR002C 1992 nt2.26□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YLL007CYLL007C 1998 nt2.25□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 PAU3YCR104W 375 nt2.25□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YPR092WYPR092W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 MCM10YIL150C 1716 nt2.25□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 SPP41YDR464W 4308 nt2.25□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 SPO75YLL005C 2607 nt2.24□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.24□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 APQ12YIL040W 417 nt2.24□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 PFD1YJL179W 330 nt2.24□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 RPS25BYLR333C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 PEP1YBL017C 4740 nt2.24□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 VPS55YJR044C 423 nt2.23□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 RRT15YLR162W-A 189 nt2.23□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 UBP2YOR124C 3819 nt2.23□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 UBR2YLR024C 5619 nt2.23□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.22□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.22□□□□□ -2.05
SSF2Q12153 SEC5YDR166C 2916 nt2.21□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 YJR039WYJR039W 3366 nt2.21□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 NPR2YEL062W 1848 nt2.2□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 LHS1YKL073W 2646 nt2.2□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 YJL120WYJL120W 324 nt2.2□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.2□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 RPL31AYDL075W 342 nt2.19□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 SLI15YBR156C 2097 nt2.19□□□□□ -2.06
SSF2Q12153 SPO21YOL091W 1830 nt2.18□□□□□ -2.06
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