Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YLR140WYLR140W 327 nt1.3□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 YCK3YER123W 1575 nt1.3□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 RFX1YLR176C 2436 nt1.29□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 SAS3YBL052C 2496 nt1.29□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 RAD50YNL250W 3939 nt1.29□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 SMC4YLR086W 4257 nt1.29□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 YOR053WYOR053W 342 nt1.29□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 NCA2YPR155C 1851 nt1.29□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 TBS1YBR150C 3285 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 YAP6YDR259C 1152 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 CYC7YEL039C 342 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 YER079WYER079W 633 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 COF1YLL050C 432 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 RPL26AYLR344W 384 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 PBY1YBR094W 2262 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 UFD2YDL190C 2886 nt1.28□□□□□ -2.2
SLM3Q12093 MVP1YMR004W 1536 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 EMC5YIL027C 426 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YJL022WYJL022W 309 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 MRPL31YKL138C 396 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YOR376WYOR376W 369 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 FIG4YNL325C 2640 nt1.27□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YLL032CYLL032C 2478 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 SDH2YLL041C 801 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YLR434CYLR434C 384 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 RPB10YOR210W 213 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 LEE1YPL054W 906 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YLL054CYLL054C 2532 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 SGO1YOR073W 1773 nt1.26□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 SPC110YDR356W 2835 nt1.25□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YDR157WYDR157W 402 nt1.25□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 HIT1YJR055W 495 nt1.25□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 TIM18YOR297C 579 nt1.25□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 BEM2YER155C 6504 nt1.25□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 MUK1YPL070W 1839 nt1.24□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YHL041WYHL041W 450 nt1.24□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 NOC3YLR002C 1992 nt1.24□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 PIG1YLR273C 1947 nt1.24□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 ALK1YGL021W 2283 nt1.23□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 BSC3YLR465C 309 nt1.23□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YNL058CYNL058C 951 nt1.23□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 SLX4YLR135W 2247 nt1.23□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YFL019CYFL019C 354 nt1.22□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YGL217CYGL217C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YHR138CYHR138C 345 nt1.22□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.22□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 NUP157YER105C 4176 nt1.22□□□□□ -2.21
SLM3Q12093 AZF1YOR113W 2745 nt1.21□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 RPL40BYKR094C 387 nt1.21□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.21□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 UPS1YLR193C 528 nt1.21□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.21□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.2□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 NUT2YPR168W 474 nt1.2□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 snR51snR51 107 nt1.2□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 AIM44YPL158C 2277 nt1.19□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 VPS55YJR044C 423 nt1.19□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.19□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YOR121CYOR121C 306 nt1.19□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 ZIP2YGL249W 2115 nt1.19□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 SCW11YGL028C 1629 nt1.18□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.18□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.18□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 EST2YLR318W 2655 nt1.18□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YDL211CYDL211C 1119 nt1.17□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YOL014WYOL014W 375 nt1.17□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 IRC23YOR044W 474 nt1.17□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.17□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 MDS3YGL197W 4464 nt1.17□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.16□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 KAP122YGL016W 3246 nt1.15□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 SEC3YER008C 4011 nt1.15□□□□□ -2.22
SLM3Q12093 SEC21YNL287W 2808 nt1.15□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 NPC2YDL046W 522 nt1.15□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 MPT5YGL178W 2580 nt1.14□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YMR160WYMR160W 2451 nt1.14□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 INP2YMR163C 2118 nt1.14□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 ENV11YGR071C 2583 nt1.13□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 snR72snR72 98 nt1.13□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YJL135WYJL135W 318 nt1.13□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.13□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.13□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 NUP145YGL092W 3954 nt1.13□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 SPT21YMR179W 2277 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YAR053WYAR053W 297 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YOR199WYOR199W 330 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 snR14snR14 160 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YSY6YBR162W-A 198 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 SLI15YBR156C 2097 nt1.12□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YDR426CYDR426C 378 nt1.11□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YOL160WYOL160W 342 nt1.11□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 EAF1YDR359C 2949 nt1.11□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YDL073WYDL073W 2955 nt1.11□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 NUT1YGL151W 3399 nt1.1□□□□□ -2.23
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