Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 DCP2YNL118C 2913 nt1.66□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.66□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YLR419WYLR419W 4308 nt1.65□□□□□ -2.14
SSK1Q07084 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.65□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YHR210CYHR210C 1026 nt1.65□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SEC63YOR254C 1992 nt1.65□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 IRE1YHR079C 3348 nt1.65□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 TDA9YML081W 3756 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 MLH3YPL164C 2148 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 MPT5YGL178W 2580 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 HMRA2YCR096C 360 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YDR366CYDR366C 399 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YGR069WYGR069W 336 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YOL160WYOL160W 342 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SEY1YOR165W 2331 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 IRA1YBR140C 9279 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SPC98YNL126W 2541 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 MYO2YOR326W 4725 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 TBS1YBR150C 3285 nt1.64□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 COG8YML071C 1824 nt1.63□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SSS1YDR086C 243 nt1.63□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YHL042WYHL042W 453 nt1.63□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.63□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 APL2YKL135C 2181 nt1.63□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 OST1YJL002C 1431 nt1.63□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 RAD61YDR014W 1944 nt1.62□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 snR60snR60 104 nt1.62□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.62□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 HMI1YOL095C 2121 nt1.62□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 PIG1YLR273C 1947 nt1.62□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 MYO4YAL029C 4416 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YJR039WYJR039W 3366 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SAS3YBL052C 2496 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 snR8snR8 190 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SDH2YLL041C 801 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 SCW11YGL028C 1629 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YOR093CYOR093C 4947 nt1.61□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 DGR2YKL121W 2559 nt1.6□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 ZIP2YGL249W 2115 nt1.6□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 INA22YIR024C 651 nt1.6□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 YJL015CYJL015C 285 nt1.6□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 LCD1YDR499W 2244 nt1.6□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 MSH6YDR097C 3729 nt1.6□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 FRK1YPL141C 2598 nt1.59□□□□□ -2.15
SSK1Q07084 RAD34YDR314C 2079 nt1.59□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 SPT21YMR179W 2277 nt1.58□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 PAU2YEL049W 363 nt1.58□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.58□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 MAD1YGL086W 2250 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 MEC1YBR136W 7107 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YCK3YER123W 1575 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YDL211CYDL211C 1119 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 PKH3YDR466W 2697 nt1.57□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.56□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 SFB2YNL049C 2631 nt1.56□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 MON2YNL297C 4911 nt1.56□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 VIK1YPL253C 1944 nt1.56□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 SPO75YLL005C 2607 nt1.55□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 REV3YPL167C 4515 nt1.55□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 SBE22YHR103W 2559 nt1.54□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 RPL34BYIL052C 366 nt1.54□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.54□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 CSE2YNR010W 450 nt1.54□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YOR015WYOR015W 360 nt1.54□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 NOC3YLR002C 1992 nt1.54□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 KCS1YDR017C 3153 nt1.53□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 RPL31AYDL075W 342 nt1.53□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.53□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.53□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 YBR064WYBR064W 429 nt1.53□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 DNF3YMR162C 4971 nt1.53□□□□□ -2.16
SSK1Q07084 SKI3YPR189W 4299 nt1.52□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 CFT1YDR301W 4074 nt1.52□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YNL028WYNL028W 318 nt1.52□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.51□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.51□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 SPO24YPR036W-A 204 nt1.51□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 VPS54YDR027C 2670 nt1.5□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.5□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 EMC5YIL027C 426 nt1.5□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 snR49snR49 165 nt1.5□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 NUT1YGL151W 3399 nt1.5□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 PIK1YNL267W 3201 nt1.49□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 PAU3YCR104W 375 nt1.49□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 snR80snR80 171 nt1.49□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YJL120WYJL120W 324 nt1.49□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.49□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 SPO21YOL091W 1830 nt1.49□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YGL052WYGL052W 306 nt1.48□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YIR044CYIR044C 186 nt1.48□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YJL022WYJL022W 309 nt1.48□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 PDE2YOR360C 1581 nt1.47□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 SPC110YDR356W 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 YGL041CYGL041C 204 nt1.47□□□□□ -2.17
SSK1Q07084 RAD50YNL250W 3939 nt1.46□□□□□ -2.18
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