Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 DGR2YKL121W 2559 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 MAD1YGL086W 2250 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 VPS55YJR044C 423 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 MRPL31YKL138C 396 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 YLR140WYLR140W 327 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 LAA1YJL207C 6045 nt1.3□□□□□ -2.2
SEH1P53011 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.29□□□□□ -2.2
SEH1P53011 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.29□□□□□ -2.2
SEH1P53011 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.29□□□□□ -2.2
SEH1P53011 NUT2YPR168W 474 nt1.29□□□□□ -2.2
SEH1P53011 snR51snR51 107 nt1.29□□□□□ -2.2
SEH1P53011 EST2YLR318W 2655 nt1.28□□□□□ -2.2
SEH1P53011 PAU2YEL049W 363 nt1.28□□□□□ -2.2
SEH1P53011 AHC1YOR023C 1701 nt1.28□□□□□ -2.2
SEH1P53011 SGO1YOR073W 1773 nt1.28□□□□□ -2.2
SEH1P53011 YGR130CYGR130C 2451 nt1.28□□□□□ -2.2
SEH1P53011 SDH2YLL041C 801 nt1.27□□□□□ -2.21
SEH1P53011 HKR1YDR420W 5409 nt1.27□□□□□ -2.21
SEH1P53011 RAD50YNL250W 3939 nt1.27□□□□□ -2.21
SEH1P53011 PBY1YBR094W 2262 nt1.27□□□□□ -2.21
SEH1P53011 SMC4YLR086W 4257 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 MVP1YMR004W 1536 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YJL015CYJL015C 285 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YJL135WYJL135W 318 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 MSN5YDR335W 3675 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 PIP2YOR363C 2991 nt1.26□□□□□ -2.21
SEH1P53011 SPC98YNL126W 2541 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 PIG1YLR273C 1947 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 UFD2YDL190C 2886 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 snR72snR72 98 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YDR426CYDR426C 378 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 RPL40BYKR094C 387 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YOR376WYOR376W 369 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 RAD9YDR217C 3930 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 RIM20YOR275C 1986 nt1.25□□□□□ -2.21
SEH1P53011 INP2YMR163C 2118 nt1.24□□□□□ -2.21
SEH1P53011 CDC36YDL165W 576 nt1.24□□□□□ -2.21
SEH1P53011 PCC1YKR095W-A 267 nt1.24□□□□□ -2.21
SEH1P53011 ZIP2YGL249W 2115 nt1.24□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YCS4YLR272C 3531 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 CDC25YLR310C 4770 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 CSN9YDR179C 489 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 RPS20YHL015W 366 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 RPL38YLR325C 237 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 NOC3YLR002C 1992 nt1.23□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.22□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YAF9YNL107W 681 nt1.22□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YOR199WYOR199W 330 nt1.22□□□□□ -2.21
SEH1P53011 TIM18YOR297C 579 nt1.22□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.22□□□□□ -2.21
SEH1P53011 YLL054CYLL054C 2532 nt1.21□□□□□ -2.22
SEH1P53011 AZF1YOR113W 2745 nt1.21□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.21□□□□□ -2.22
SEH1P53011 IML1YJR138W 4755 nt1.21□□□□□ -2.22
SEH1P53011 APL2YKL135C 2181 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 RPL35AYDL191W 363 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YGL217CYGL217C 342 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 Q0142Q0142 177 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 RSM22YKL155C 1887 nt1.2□□□□□ -2.22
SEH1P53011 SCW11YGL028C 1629 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 SLX4YLR135W 2247 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 NPC2YDL046W 522 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 RRT15YLR162W-A 189 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 HTB2YBL002W 396 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YSY6YBR162W-A 198 nt1.19□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
SEH1P53011 TRM732YMR259C 4263 nt1.18□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YAR029WYAR029W 225 nt1.18□□□□□ -2.22
SEH1P53011 VPS54YDR027C 2670 nt1.17□□□□□ -2.22
SEH1P53011 AIM44YPL158C 2277 nt1.17□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YDR048CYDR048C 315 nt1.17□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YKL136WYKL136W 399 nt1.17□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YOL160WYOL160W 342 nt1.17□□□□□ -2.22
SEH1P53011 ENV11YGR071C 2583 nt1.16□□□□□ -2.22
SEH1P53011 NUT1YGL151W 3399 nt1.16□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YDL211CYDL211C 1119 nt1.16□□□□□ -2.22
SEH1P53011 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.16□□□□□ -2.22
SEH1P53011 MDS3YGL197W 4464 nt1.16□□□□□ -2.22
SEH1P53011 STF2YGR008C 255 nt1.15□□□□□ -2.23
SEH1P53011 snR36snR36 182 nt1.15□□□□□ -2.23
SEH1P53011 SLI15YBR156C 2097 nt1.15□□□□□ -2.23
SEH1P53011 SPO75YLL005C 2607 nt1.15□□□□□ -2.23
SEH1P53011 BUD3YCL014W 4911 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YDR102CYDR102C 333 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.14□□□□□ -2.23
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