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Protein–RNA interactions for Protein: P40317
SOK1, Protein SOK1, yeast
Predictions only
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901 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SOK1
P40317
tT(AGU)I1
tT(AGU)I1
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0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)I2
tT(AGU)I2
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)J
tT(AGU)J
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)N2
tT(AGU)N2
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
URM1
YIL008W
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SOK1
P40317
PHS1
YJL097W
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
NFU1
YKL040C
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
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YBR221W-A
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SOK1
P40317
SET3
YKR029C
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YCR001W
YCR001W
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MXR1
YER042W
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
EAF6
YJR082C
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SOK1
P40317
YPR153W
YPR153W
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
NOC3
YLR002C
1992 nt
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
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YLL032C
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
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YDR114C
303 nt
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
CYC7
YEL039C
342 nt
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YGL239C
YGL239C
315 nt
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
BIG1
YHR101C
1008 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
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YLR146W-A
189 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YMR141W-A
YMR141W-A
225 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
PBI2
YNL015W
228 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
CDC33
YOL139C
642 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YDL158C
YDL158C
309 nt
0.59
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MRPL31
YKL138C
396 nt
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□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MPT5
YGL178W
2580 nt
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SOK1
P40317
SCW11
YGL028C
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0.59
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
RFX1
YLR176C
2436 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
WIP1
YDR374W-A
270 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YGR045C
YGR045C
363 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YIL066W-A
YIL066W-A
444 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
AIM29
YKR074W
468 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YOR192C-C
YOR192C-C
237 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
STO1
YMR125W
2586 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
UPS1
YLR193C
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0.57
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YOR032W-A
YOR032W-A
201 nt
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□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YBR012C
YBR012C
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□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
SWI6
YLR182W
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□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
SWF1
YDR126W
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SOK1
P40317
YEL030C-A
YEL030C-A
315 nt
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SOK1
P40317
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YER087C-A
552 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
PAU12
YGR294W
363 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YML108W
YML108W
318 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
FIG4
YNL325C
2640 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YDR269C
YDR269C
324 nt
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SOK1
P40317
QCR9
YGR183C
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SOK1
P40317
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YGR290W
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SOK1
P40317
FYV7
YLR068W
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SOK1
P40317
YCK3
YER123W
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SOK1
P40317
SLY1
YDR189W
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SOK1
P40317
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YDL196W
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SOK1
P40317
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YGR042W
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SOK1
P40317
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YIL059C
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SOK1
P40317
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YKL145W-A
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0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
RRT1
YBL048W
312 nt
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SOK1
P40317
LCD1
YDR499W
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SOK1
P40317
ALY2
YJL084C
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SOK1
P40317
LTE1
YAL024C
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SOK1
P40317
YHR125W
YHR125W
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SOK1
P40317
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YOR199W
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SOK1
P40317
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YBR076C-A
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SOK1
P40317
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YML002W
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SOK1
P40317
NPC2
YDL046W
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SOK1
P40317
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YBL071C
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SOK1
P40317
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YNL122C
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SOK1
P40317
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YOL109W
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SOK1
P40317
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YPL182C
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SOK1
P40317
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YBR200W-A
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YDL206W
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YEL050W-A
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SOK1
P40317
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P40317
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P40317
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P40317
snR72
snR72
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P40317
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P40317
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YOL014W
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YDL011C
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YHR130C
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YAL016C-B
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YJL135W
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YLR287C
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□□□□□ -2.33
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P40317
GEA2
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SOK1
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SOK1
P40317
RPS27A
YKL156W
249 nt
0.48
□□□□□ -2.33
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