Protein–RNA interactions for Protein: P38844

DSE2, Protein DSE2, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE2P38844 MPT5YGL178W 2580 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YER079WYER079W 633 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YGR042WYGR042W 816 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YHL041WYHL041W 450 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 UPS1YLR193C 528 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YBL108WYBL108W 306 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SAS3YBL052C 2496 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EFR3YMR212C 2349 nt0.75□□□□□ -2.29
DSE2P38844 PCF11YDR228C 1881 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SWF1YDR126W 1011 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 VAR1Q0140 1197 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 RPS27AYKL156W 249 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YLR255CYLR255C 354 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 ISF1YMR081C 1017 nt0.74□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SET3YKR029C 2256 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 FIG4YNL325C 2640 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 snR72snR72 98 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YKL083WYKL083W 615 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YAR047CYAR047C 321 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 LEE1YPL054W 906 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 NUP192YJL039C 5052 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SPT7YBR081C 3999 nt0.73□□□□□ -2.29
DSE2P38844 STO1YMR125W 2586 nt0.72□□□□□ -2.29
DSE2P38844 LCD1YDR499W 2244 nt0.72□□□□□ -2.29
DSE2P38844 SMC1YFL008W 3678 nt0.72□□□□□ -2.29
DSE2P38844 AGA2YGL032C 264 nt0.72□□□□□ -2.29
DSE2P38844 YJL135WYJL135W 318 nt0.72□□□□□ -2.29
DSE2P38844 MUK1YPL070W 1839 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 SLY1YDR189W 2001 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 NPC2YDL046W 522 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YHR138CYHR138C 345 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 RRT1YBL048W 312 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YNL324WYNL324W 396 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 RPB10YOR210W 213 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YPL185WYPL185W 396 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YBR285WYBR285W 435 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 MSH3YCR092C 3057 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 ZIP2YGL249W 2115 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 BEM2YER155C 6504 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YJR003CYJR003C 1560 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 AIM9YER080W 1884 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 PAC1YOR269W 1485 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 IRC23YOR044W 474 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YBR012CYBR012C 420 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 snR51snR51 107 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 NST1YNL091W 3723 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE2P38844 SPO75YLL005C 2607 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YKL063CYKL063C 504 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YKL202WYKL202W 582 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YML003WYML003W 873 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YOR199WYOR199W 330 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE2P38844 SCC2YDR180W 4482 nt0.68□□□□□ -2.3
DSE2P38844 COG4YPR105C 2586 nt0.68□□□□□ -2.3
DSE2P38844 SLI15YBR156C 2097 nt0.68□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YPL229WYPL229W 621 nt0.68□□□□□ -2.3
DSE2P38844 GEA2YEL022W 4380 nt0.68□□□□□ -2.3
DSE2P38844 MYO1YHR023W 5787 nt0.68□□□□□ -2.3
DSE2P38844 NUP145YGL092W 3954 nt0.67□□□□□ -2.3
DSE2P38844 AIM44YPL158C 2277 nt0.67□□□□□ -2.3
DSE2P38844 RKR1YMR247C 4689 nt0.67□□□□□ -2.3
DSE2P38844 BSC3YLR465C 309 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YOL160WYOL160W 342 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YOR053WYOR053W 342 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 YDL206WYDL206W 2289 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 PDE2YOR360C 1581 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE2P38844 SIP4YJL089W 2490 nt0.65□□□□□ -2.3
DSE2P38844 CSN9YDR179C 489 nt0.65□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.65□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.65□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.65□□□□□ -2.31
DSE2P38844 MMS4YBR098W 2076 nt0.65□□□□□ -2.31
DSE2P38844 ALY2YJL084C 3141 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 SAC3YDR159W 3906 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 SEC3YER008C 4011 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 RPS20YHL015W 366 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 DOP1YDR141C 5097 nt0.64□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YAR009CYAR009C 3591 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 RAD34YDR314C 2079 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 WAR1YML076C 2835 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YDL196WYDL196W 330 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE2P38844 YOR121CYOR121C 306 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.9 ms