Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 RPL39YJL189W 156 nt1.64□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 ENV11YGR071C 2583 nt1.63□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 MEC1YBR136W 7107 nt1.63□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YLR255CYLR255C 354 nt1.63□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 PIG1YLR273C 1947 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 IRA1YBR140C 9279 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 STE5YDR103W 2754 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YFL063WYFL063W 456 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YAR029WYAR029W 225 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YOL160WYOL160W 342 nt1.62□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 KCS1YDR017C 3153 nt1.61□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 APL2YKL135C 2181 nt1.61□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.61□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 PAU2YEL049W 363 nt1.61□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 ZIP2YGL249W 2115 nt1.61□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 SKI3YPR189W 4299 nt1.61□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 BRR2YER172C 6492 nt1.6□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YOR019WYOR019W 2193 nt1.6□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 RPL31AYDL075W 342 nt1.6□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YGL149WYGL149W 306 nt1.6□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.6□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 SPO24YPR036W-A 204 nt1.6□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.59□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 HTL1YCR020W-B 237 nt1.59□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.59□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 MON2YNL297C 4911 nt1.59□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 DNF3YMR162C 4971 nt1.59□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 SDH2YLL041C 801 nt1.58□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.58□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YBR174CYBR174C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 CAT8YMR280C 4302 nt1.58□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 VPS15YBR097W 4365 nt1.58□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 DBP6YNR038W 1890 nt1.57□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YIL102CYIL102C 306 nt1.57□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 FIG2YCR089W 4830 nt1.57□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 CTF4YPR135W 2784 nt1.57□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 NIP100YPL174C 2607 nt1.56□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 EMC5YIL027C 426 nt1.56□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 PFD1YJL179W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.56□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 CCH1YGR217W 6120 nt1.55□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 SBE22YHR103W 2559 nt1.55□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 REV3YPL167C 4515 nt1.55□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 MAD1YGL086W 2250 nt1.55□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.55□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YPR063CYPR063C 423 nt1.55□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YLR419WYLR419W 4308 nt1.54□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 snR65snR65 100 nt1.54□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.54□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 OST1YJL002C 1431 nt1.54□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 NOC3YLR002C 1992 nt1.54□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 RAD34YDR314C 2079 nt1.54□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 SEC5YDR166C 2916 nt1.53□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YJL022WYJL022W 309 nt1.53□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.53□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 SPC98YNL126W 2541 nt1.53□□□□□ -2.16
YBL055CP34220 RAD50YNL250W 3939 nt1.53□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YDL211CYDL211C 1119 nt1.52□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 UFD2YDL190C 2886 nt1.52□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YER181CYER181C 324 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YIL032CYIL032C 357 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 COF1YLL050C 432 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 BST1YFL025C 3090 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 PET127YOR017W 2403 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SCW11YGL028C 1629 nt1.51□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 KIP1YBL063W 3336 nt1.5□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SMC4YLR086W 4257 nt1.5□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.5□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 CDC31YOR257W 486 nt1.5□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 ALK1YGL021W 2283 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 NUP192YJL039C 5052 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 NUT1YGL151W 3399 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YCS4YLR272C 3531 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YLR422WYLR422W 5799 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 MPT5YGL178W 2580 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SPT21YMR179W 2277 nt1.49□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SLX4YLR135W 2247 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YCK3YER123W 1575 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SSS1YDR086C 243 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YDR344CYDR344C 444 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YGL217CYGL217C 342 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YLR140WYLR140W 327 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YOR376WYOR376W 369 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 VPS54YDR027C 2670 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SXM1YDR395W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 NCA2YPR155C 1851 nt1.48□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SLI15YBR156C 2097 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 KAP122YGL016W 3246 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 snR60snR60 104 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YHL042WYHL042W 453 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 RPL34BYIL052C 366 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 YIR044CYIR044C 186 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 LCD1YDR499W 2244 nt1.47□□□□□ -2.17
YBL055CP34220 SPC110YDR356W 2835 nt1.46□□□□□ -2.18
YBL055CP34220 CHS1YNL192W 3396 nt1.46□□□□□ -2.18
YBL055CP34220 CUL3YGR003W 2235 nt1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms