Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNIKQ9UKE5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNIKQ9UKE5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms