Protein–RNA interactions for Protein: Q12414

TY1B-PL, Transposon Ty1-PL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-PLQ12414 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 BET4YJL031C 984 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 YJL032WYJL032W 315 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 SBH1YER087C-B 249 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 SWM2YNR004W 441 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 VPS28YPL065W 729 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 YPR142CYPR142C 564 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-PLQ12414 YDR114CYDR114C 303 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 CRG1YHR209W 876 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YKL115CYKL115C 393 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 PRP42YDR235W 1635 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YPR172WYPR172W 603 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 RTC6YPL183W-A 282 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YPR170CYPR170C 336 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YKL136WYKL136W 399 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 PHO80YOL001W 882 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 snR46snR46 197 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YGR042WYGR042W 816 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 RPL42BYHR141C 321 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 RFA3YJL173C 369 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 CCE1YKL011C 1062 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 RPL42AYNL162W 321 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YPL080CYPL080C 327 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 YPL225WYPL225W 441 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 RAD34YDR314C 2079 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 LEE1YPL054W 906 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-PLQ12414 RCO1YMR075W 2055 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 UPS1YLR193C 528 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 RRT1YBL048W 312 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 GPI2YPL076W 843 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 LCD1YDR499W 2244 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 GOS1YHL031C 672 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 RTR2YDR066C 591 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YLR252WYLR252W 306 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YDL187CYDL187C 330 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YDL068WYDL068W 330 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YLR101CYLR101C 396 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 SMD2YLR275W 333 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YEL010WYEL010W 351 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 MMS2YGL087C 414 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 GPG1YGL121C 381 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 RPS16AYMR143W 432 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YOR169CYOR169C 465 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 INP2YMR163C 2118 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 SPO23YBR250W 1572 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 HNT1YDL125C 477 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YJL086CYJL086C 369 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YNL150WYNL150W 408 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 ATP15YPL271W 189 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 REF2YDR195W 1602 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 RPS27AYKL156W 249 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YNL050CYNL050C 813 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 YBR071WYBR071W 636 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-PLQ12414 BI3Q0115 1554 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 LSM4YER112W 564 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 HOT13YKL084W 351 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YNL211CYNL211C 261 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 FYV10YIL097W 1551 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 SRP14YDL092W 441 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 AI5_BETAQ0075 1065 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 PRP21YJL203W 843 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 EFR3YMR212C 2349 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YCL002CYCL002C 792 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 RAD61YDR014W 1944 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 NUP82YJL061W 2142 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 KAR1YNL188W 1302 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YDR029WYDR029W 315 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YHL042WYHL042W 453 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 AFB1YLR040C 675 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 COX8YLR395C 237 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 snR8snR8 190 nt-0.39□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.39□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 MIC19YFR011C 513 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 ARV1YLR242C 966 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YOP1YPR028W 543 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 CMS1YLR003C 876 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-PLQ12414 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 YDR210WYDR210W 228 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 YDR290WYDR290W 330 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 RPM2YML091C 3609 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 SEC10YLR166C 2616 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 YBR184WYBR184W 1572 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 YJR011CYJR011C 786 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 HTB2YBL002W 396 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 CSM4YPL200W 471 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 YGL042CYGL042C 306 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-PLQ12414 THG1YGR024C 714 nt-0.44□□□□□ -2.48
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