Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 YBR012CYBR012C 420 nt2.09□□□□□ -2.07
NYV1Q12255 CHC1YGL206C 4962 nt2.09□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 MDM20YOL076W 2391 nt2.09□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 SWI6YLR182W 2412 nt2.09□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 UBP2YOR124C 3819 nt2.09□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YNL144CYNL144C 2223 nt2.09□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 CHS1YNL192W 3396 nt2.08□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 TRX1YLR043C 312 nt2.08□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YPL261CYPL261C 309 nt2.08□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YCL046WYCL046W 324 nt2.08□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 LYS14YDR034C 2373 nt2.08□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 NOP14YDL148C 2433 nt2.07□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 MCD1YDL003W 1701 nt2.07□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 IRE1YHR079C 3348 nt2.07□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YOR093CYOR093C 4947 nt2.07□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.06□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 EFR3YMR212C 2349 nt2.06□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 RFX1YLR176C 2436 nt2.06□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 HCH1YNL281W 462 nt2.05□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YOP1YPR028W 543 nt2.05□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 NUT2YPR168W 474 nt2.05□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 DNF3YMR162C 4971 nt2.05□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 PMD1YER132C 5262 nt2.05□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 SKI3YPR189W 4299 nt2.05□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 AGC1YPR021C 2709 nt2.04□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 HSL1YKL101W 4557 nt2.04□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 GIM4YEL003W 336 nt2.04□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 CDC31YOR257W 486 nt2.04□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 MSH3YCR092C 3057 nt2.04□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 HMI1YOL095C 2121 nt2.03□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.03□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 RPL27BYDR471W 411 nt2.03□□□□□ -2.08
NYV1Q12255 ENV11YGR071C 2583 nt2.02□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.02□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 CAT8YMR280C 4302 nt2.02□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 PKH3YDR466W 2697 nt2.02□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.01□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 ZIP1YDR285W 2628 nt2.01□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 RPL38YLR325C 237 nt2.01□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 IRC23YOR044W 474 nt2.01□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 SLY1YDR189W 2001 nt2.01□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 MUK1YPL070W 1839 nt2.01□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 PAU2YEL049W 363 nt2□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 PAU12YGR294W 363 nt2□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 PAU24YBR301W 363 nt2□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 MLH3YPL164C 2148 nt2□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 YGR130CYGR130C 2451 nt1.99□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 UTP21YLR409C 2820 nt1.98□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.98□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 LHS1YKL073W 2646 nt1.98□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 DGR2YKL121W 2559 nt1.98□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 FRK1YPL141C 2598 nt1.98□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 ELG1YOR144C 2376 nt1.97□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 CYC7YEL039C 342 nt1.97□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 EMC5YIL027C 426 nt1.97□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 YAR053WYAR053W 297 nt1.97□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 YLL032CYLL032C 2478 nt1.97□□□□□ -2.09
NYV1Q12255 PAC1YOR269W 1485 nt1.96□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 RPS20YHL015W 366 nt1.96□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 YNL058CYNL058C 951 nt1.96□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 BIL1YOR304C-A 231 nt1.96□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 YPR197CYPR197C 564 nt1.96□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.95□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 PAU3YCR104W 375 nt1.95□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 PIG1YLR273C 1947 nt1.95□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 SGO1YOR073W 1773 nt1.95□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 APL2YKL135C 2181 nt1.95□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 NUT1YGL151W 3399 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 RPL31AYDL075W 342 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 UPS1YLR193C 528 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 RTP1YMR185W 2946 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 FIG2YCR089W 4830 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 CLU1YMR012W 3834 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 COG4YPR105C 2586 nt1.94□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 RIM20YOR275C 1986 nt1.93□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 YHL041WYHL041W 450 nt1.93□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 MRPL31YKL138C 396 nt1.93□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 SAR1YPL218W 573 nt1.93□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 RKM1YPL208W 1752 nt1.93□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 KAP122YGL016W 3246 nt1.92□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 YLR422WYLR422W 5799 nt1.91□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.91□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.1
NYV1Q12255 PFD1YJL179W 330 nt1.9□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.9□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.9□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 snR51snR51 107 nt1.9□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 LRE1YCL051W 1752 nt1.9□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 YMR045CYMR045C 5268 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 RPL40BYKR094C 387 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 INP2YMR163C 2118 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 SPO24YPR036W-A 204 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 MVP1YMR004W 1536 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 SAS3YBL052C 2496 nt1.89□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 MYO2YOR326W 4725 nt1.88□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.88□□□□□ -2.11
NYV1Q12255 LAA1YJL207C 6045 nt1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.2 ms